182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1465 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  100 
 
 
219 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  100 
 
 
219 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  55.83 
 
 
227 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  53.77 
 
 
219 aa  211  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  53.77 
 
 
219 aa  211  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  53.73 
 
 
205 aa  208  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  53.85 
 
 
218 aa  208  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  53 
 
 
222 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  56.31 
 
 
219 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  58.13 
 
 
233 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  50.67 
 
 
222 aa  201  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  53.5 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  55.05 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  54.55 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  53.03 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  53 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  52.02 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  53.88 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  52.02 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  52.02 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  52.02 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  52.02 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  59 
 
 
216 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  55.17 
 
 
234 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  52.76 
 
 
220 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  53.73 
 
 
223 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  52.26 
 
 
220 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  55.68 
 
 
228 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  55.68 
 
 
228 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  53 
 
 
260 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  48.1 
 
 
221 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  53.57 
 
 
220 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  49.75 
 
 
221 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  52.26 
 
 
220 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  52.76 
 
 
220 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  52.76 
 
 
220 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  52.76 
 
 
220 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  49.25 
 
 
221 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  48.74 
 
 
221 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  56.18 
 
 
234 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  51.02 
 
 
220 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  55.06 
 
 
227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  51.02 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  50.93 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  52.72 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  53.89 
 
 
247 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  55.38 
 
 
223 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  56.18 
 
 
224 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  50 
 
 
226 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  56.41 
 
 
223 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  48.48 
 
 
220 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  51.44 
 
 
226 aa  177  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  50.96 
 
 
226 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  47.95 
 
 
230 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  50.26 
 
 
220 aa  174  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  48.8 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  47.93 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  48.77 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  48.4 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  52.57 
 
 
226 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  49.72 
 
 
228 aa  167  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  48.06 
 
 
225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  43.52 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  43.46 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  45.92 
 
 
225 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  42.47 
 
 
224 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2460  peptidase M50  53.17 
 
 
217 aa  161  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754633  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  42.99 
 
 
213 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  44.17 
 
 
224 aa  158  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  45.67 
 
 
227 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  45.83 
 
 
225 aa  155  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  45.54 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  45.03 
 
 
235 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  46.38 
 
 
224 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  40.28 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  39.71 
 
 
214 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  41.75 
 
 
220 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  43.56 
 
 
224 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  44.29 
 
 
226 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  39.6 
 
 
202 aa  131  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  42.02 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  44.04 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  43.96 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  39.32 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  44.56 
 
 
214 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  38.78 
 
 
231 aa  128  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  40.85 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  39.39 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  39.39 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  39.39 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  39.39 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  39.39 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  39.39 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  39.39 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  39.11 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  39.39 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  39.9 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  43.5 
 
 
207 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  39.8 
 
 
224 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  38.89 
 
 
224 aa  124  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>