19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1418 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  231  2e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  99.12 
 
 
113 aa  229  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  55.65 
 
 
115 aa  130  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  51.75 
 
 
113 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  52.21 
 
 
113 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  53.1 
 
 
114 aa  119  1e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  48.72 
 
 
113 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  51.33 
 
 
115 aa  112  1e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  56.82 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  34.19 
 
 
118 aa  80.5  8e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  40.54 
 
 
123 aa  75.1  3e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  40.85 
 
 
110 aa  70.1  9e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  39.24 
 
 
127 aa  66.2  1e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  36.27 
 
 
119 aa  54.7  5e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  33.75 
 
 
131 aa  49.3  2e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  32.22 
 
 
120 aa  48.5  3e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  25.2 
 
 
134 aa  48.1  4e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  31.11 
 
 
120 aa  47.8  6e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  5.80905e-14 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1854  hypothetical protein  32.88 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>