171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1398 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  97.57 
 
 		 834 aa  1621    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  94.25 
 
 		 809 aa  1526    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  100 
 
 		 828 aa  1710    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  53.31 
 
 		 823 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  46.86 
 
 		 637 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  46.86 
 
 		 637 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  46.65 
 
 		 634 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  43.44 
 
 		 626 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  43.88 
 
 		 645 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  42.5 
 
 		 644 aa  382  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  47.69 
 
 		 669 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  43.01 
 
 		 674 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  47.35 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  47.16 
 
 		 664 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  46.32 
 
 		 663 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  46.97 
 
 		 573 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  47.6 
 
 		 665 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  43.99 
 
 		 661 aa  366  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  44.44 
 
 		 687 aa  365  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  44.21 
 
 		 665 aa  365  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  45.25 
 
 		 661 aa  365  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  47.82 
 
 		 659 aa  365  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  48.03 
 
 		 662 aa  364  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  46.5 
 
 		 678 aa  364  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  46.94 
 
 		 663 aa  363  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  46.48 
 
 		 668 aa  363  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  47.6 
 
 		 659 aa  363  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  46.27 
 
 		 670 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  44.94 
 
 		 700 aa  362  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  47.6 
 
 		 666 aa  362  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  47.38 
 
 		 662 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  46.06 
 
 		 673 aa  361  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  47.38 
 
 		 666 aa  361  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  46.72 
 
 		 660 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  45.96 
 
 		 666 aa  360  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  46.34 
 
 		 669 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  43.27 
 
 		 661 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  47.16 
 
 		 664 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  45.84 
 
 		 665 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  45.16 
 
 		 660 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  44.19 
 
 		 661 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  46.29 
 
 		 669 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  45.81 
 
 		 660 aa  358  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  43.85 
 
 		 664 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  46.51 
 
 		 661 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  46.52 
 
 		 676 aa  357  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  45.96 
 
 		 667 aa  357  6.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  45.41 
 
 		 666 aa  356  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  43.8 
 
 		 662 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  45.84 
 
 		 669 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  45.85 
 
 		 665 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  45.42 
 
 		 675 aa  354  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  45.94 
 
 		 687 aa  353  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  43.13 
 
 		 672 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  43.85 
 
 		 664 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  45.57 
 
 		 666 aa  351  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  46.29 
 
 		 663 aa  351  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  46.29 
 
 		 663 aa  351  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  45.95 
 
 		 661 aa  350  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  46.46 
 
 		 661 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  45.59 
 
 		 660 aa  347  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  50.26 
 
 		 670 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  45.08 
 
 		 723 aa  333  7.000000000000001e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  39.76 
 
 		 756 aa  324  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  45.24 
 
 		 531 aa  296  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  35.31 
 
 		 630 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  34.11 
 
 		 627 aa  241  5e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  34 
 
 		 641 aa  213  2e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  31.51 
 
 		 714 aa  209  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  32.53 
 
 		 723 aa  208  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  32.15 
 
 		 648 aa  207  9e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  32.71 
 
 		 658 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  31.78 
 
 		 651 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  31.47 
 
 		 713 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  31.39 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5160  TRAG family protein  33.19 
 
 		 638 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  30.57 
 
 		 594 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  30.75 
 
 		 576 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  30.24 
 
 		 575 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  29.85 
 
 		 583 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  28.89 
 
 		 648 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  30.09 
 
 		 570 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  28.6 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  30.09 
 
 		 557 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  30.09 
 
 		 570 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  27.21 
 
 		 559 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  28.19 
 
 		 695 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  30.09 
 
 		 677 aa  165  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  26.96 
 
 		 670 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  30.2 
 
 		 554 aa  163  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0023  conjugal transfer protein  27.03 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  29.37 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  29.09 
 
 		 560 aa  160  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7522  TRAG family protein  29.55 
 
 		 601 aa  159  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.445518  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  26.36 
 
 		 699 aa  157  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  30.3 
 
 		 633 aa  154  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  26.77 
 
 		 678 aa  154  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  25.96 
 
 		 699 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  29.84 
 
 		 714 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2342  TRAG family protein  27.96 
 
 		 585 aa  148  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.910402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>