254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1376 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  87.27 
 
 		 267 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  85.77 
 
 		 267 aa  481  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  84.64 
 
 		 267 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  84.64 
 
 		 267 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  85.39 
 
 		 267 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  84.03 
 
 		 307 aa  474  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  84.03 
 
 		 278 aa  474  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  82.77 
 
 		 267 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  80.9 
 
 		 268 aa  461  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  80.53 
 
 		 266 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  77.53 
 
 		 267 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  78.79 
 
 		 268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  81.89 
 
 		 271 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  73.31 
 
 		 269 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  72.35 
 
 		 268 aa  417  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  71.76 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  73.95 
 
 		 272 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  70.79 
 
 		 268 aa  401  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  68.82 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  68.82 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  68.18 
 
 		 266 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  67.42 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  67.04 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  68.36 
 
 		 265 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  66.15 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  63.32 
 
 		 266 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  61.87 
 
 		 265 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  59.47 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.24 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  53.31 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.59 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  56.7 
 
 		 270 aa  322  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  60.24 
 
 		 276 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  55.73 
 
 		 279 aa  319  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.25 
 
 		 286 aa  313  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  55.73 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  56.42 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  56.69 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  54.51 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  56.59 
 
 		 282 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  54.37 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  56.59 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  56.59 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  53.52 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.37 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  54.03 
 
 		 275 aa  292  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  53.36 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  57.02 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.33 
 
 		 271 aa  285  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  52.16 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  54.77 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  54.33 
 
 		 270 aa  281  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  51.56 
 
 		 260 aa  281  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.47 
 
 		 270 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  52.23 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  54.72 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.78 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  48.83 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  53.2 
 
 		 269 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  53.44 
 
 		 270 aa  278  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  50.81 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  54.17 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  50.59 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  50.59 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  53.94 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  50.39 
 
 		 265 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  49.39 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  49.8 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  51.97 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  51.97 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  51.97 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  51.17 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  51.97 
 
 		 282 aa  261  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  45.08 
 
 		 266 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  44.67 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  47.14 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  47.14 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  47.14 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.2 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.83 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.51 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  29.25 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.97 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  25.7 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  25.7 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.41 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  29.88 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  28.06 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  30.05 
 
 		 4917 aa  82.8  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  26.02 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  27.93 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  27.93 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  27.37 
 
 		 4844 aa  79.3  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  27.4 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  25.94 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  25.94 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  25.94 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  25.94 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>