More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1365 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1365  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 259 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1668  transcriptional regulator, IclR family  99.23 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.145248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  43.67 
 
 		 268 aa  174  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  41.92 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  42.02 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  43.48 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  43.48 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  41.63 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  43.7 
 
 		 286 aa  171  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  44.26 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  41.11 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  42.86 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  42.62 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  39.47 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  40.33 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  40 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  34.47 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.8 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.4 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  36.16 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  31.25 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.69 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.57 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  31.84 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  31.84 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  31.84 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  31.84 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  31.84 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  31.84 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  31.84 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.83 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  31.88 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.57 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  34.22 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.45 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  31.75 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  31.75 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  31.75 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  29.61 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  31.75 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  30.54 
 
 		 294 aa  95.5  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>