62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1287 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  100 
 
 		 932 aa  1932    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  65.91 
 
 		 928 aa  1264    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  74.14 
 
 		 928 aa  1433    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  66.67 
 
 		 926 aa  1279    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  59.6 
 
 		 622 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  59.7 
 
 		 921 aa  1125    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  67.78 
 
 		 926 aa  1307    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  64.43 
 
 		 918 aa  1233    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  59.18 
 
 		 909 aa  1105    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  53.69 
 
 		 929 aa  956    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  38.45 
 
 		 912 aa  655    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  37.62 
 
 		 914 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  37.11 
 
 		 916 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  37.36 
 
 		 871 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  35.14 
 
 		 933 aa  502  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  34.68 
 
 		 937 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  33.81 
 
 		 908 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  32.62 
 
 		 909 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  33.41 
 
 		 934 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  35.05 
 
 		 919 aa  443  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  31.98 
 
 		 928 aa  436  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  33.22 
 
 		 941 aa  415  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  31 
 
 		 934 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  32.85 
 
 		 955 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  31.14 
 
 		 929 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  25.8 
 
 		 978 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1173 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  27.6 
 
 		 621 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1151 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1018 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1184 aa  121  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  25.93 
 
 		 973 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  24.17 
 
 		 925 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1188 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1170 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1154 aa  111  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  24.52 
 
 		 918 aa  111  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  22.25 
 
 		 1186 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0349  hypothetical protein  56.84 
 
 		 115 aa  99.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270538  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  22.21 
 
 		 869 aa  75.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1353 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  66.6  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1347 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.24 
 
 		 694 aa  59.7  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1366 aa  60.1  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1282 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1452 aa  52.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  20.71 
 
 		 995 aa  52.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  20.93 
 
 		 536 aa  51.6  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  26.63 
 
 		 1041 aa  48.9  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1290 aa  48.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  19.6 
 
 		 504 aa  48.5  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1298 aa  48.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1342 aa  47.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1409 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  19.48 
 
 		 1363 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  20.63 
 
 		 1346 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  35.06 
 
 		 1239 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.77 
 
 		 950 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1373 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  40 
 
 		 1167 aa  44.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1321 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>