93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1230 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 		 102 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  99.02 
 
 		 102 aa  210  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  57.89 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  52 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  55.79 
 
 		 97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  55.79 
 
 		 97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.06 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  51.52 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  49.5 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.99 
 
 		 100 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  56.99 
 
 		 100 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  54.26 
 
 		 97 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  54.08 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  49.47 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.08 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  54.74 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  54.46 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  46.81 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.87 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.13 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.11 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.56 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  45.74 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  45.74 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  45.83 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.54 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.74 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  47.87 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  43.75 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.16 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.21 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  38.54 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  51.72 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  41.05 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  47.96 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.62 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  50 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  39.18 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  39.58 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  43.48 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  41.3 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  43.33 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  39.77 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  37.23 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.54 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.33 
 
 		 331 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 431 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2937  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106221  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.71 
 
 		 411 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.3 
 
 		 411 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.3 
 
 		 411 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.3 
 
 		 411 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.3 
 
 		 411 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1813  ferredoxin, 4Fe-4S  36 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0265  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.41 
 
 		 427 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  33.33 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.57 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.78 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.11 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.73 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  40 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0586  ferredoxin  32.39 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.72 
 
 		 421 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0237  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0468  signal-transduction protein  32.1 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.125396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  29.49 
 
 		 1190 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1868  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.59 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  36.76 
 
 		 411 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.91 
 
 		 455 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  30.86 
 
 		 417 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0563  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.81 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.978670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.03 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.879675  normal  0.609652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.33 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0573  hypothetical protein  33.77 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.575358  decreased coverage  0.000394368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1955  ferredoxin  27.06 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0216  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.43 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00676353  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1006  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0104746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0477  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 435 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00748244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.26 
 
 		 404 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  32.88 
 
 		 426 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000269447  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 394 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.67 
 
 		 422 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0298  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 		 1178 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 381 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 435 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.58 
 
 		 432 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.38 
 
 		 432 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0032  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.86 
 
 		 61 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>