35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1215 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  904    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  100 
 
 		 442 aa  904    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  45.51 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  35.95 
 
 		 428 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  35.95 
 
 		 428 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0310  hypothetical protein  39.47 
 
 		 182 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.757938  hitchhiker  0.0000731062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0114  hypothetical protein  24.64 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  23.98 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  25.19 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  32.89 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1951  hypothetical protein  22.34 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2309  hypothetical protein  22.34 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0988635  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  24.06 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  24.06 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  26.15 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  24.85 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  25.28 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  29.48 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  34.88 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  33.11 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  26.18 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  28.9 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  25.71 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  26.03 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  22.75 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1310  hypothetical protein  21.76 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00248833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  24.22 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  29.03 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  23.81 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  26.09 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  26.09 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  26.09 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  22.25 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  22.05 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>