240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1017 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 362 aa  748    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 362 aa  748    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  67.69 
 
 		 359 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  62.88 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  61.73 
 
 		 360 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  65.08 
 
 		 360 aa  474  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  62.46 
 
 		 360 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  62.75 
 
 		 360 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  63.41 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  61.69 
 
 		 360 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  60.78 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1746  phosphoserine aminotransferase  59.67 
 
 		 361 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1849  phosphoserine aminotransferase  59.83 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0324861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  59.12 
 
 		 361 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2167  phosphoserine aminotransferase  61.73 
 
 		 377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.278271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  58.84 
 
 		 361 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  58.29 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  59.94 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3946  phosphoserine aminotransferase  58.01 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202665  normal  0.0186583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4077  phosphoserine aminotransferase  57.34 
 
 		 363 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.011582  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1962  phosphoserine aminotransferase  58.01 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1338  phosphoserine aminotransferase  59.44 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.175355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  60.06 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  58.66 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1422  phosphoserine aminotransferase  58.33 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1205  phosphoserine aminotransferase  58.66 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.468317  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  57.85 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  56.3 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1420  phosphoserine aminotransferase  56.98 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.454593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  56.86 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0740  phosphoserine aminotransferase  56.86 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  56.3 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  56.58 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  56.27 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  56.58 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  57.14 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2576  phosphoserine aminotransferase  56.68 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0448308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  56.3 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1001  phosphoserine aminotransferase  56.3 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2792  phosphoserine aminotransferase  56.71 
 
 		 368 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  58.93 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  56.02 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1570  phosphoserine aminotransferase  56.71 
 
 		 370 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1793  phosphoserine aminotransferase  55.89 
 
 		 368 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  55.83 
 
 		 367 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  56.91 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  57.5 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1359  phosphoserine aminotransferase  57.74 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416954  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  56.27 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  56.67 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1041  phosphoserine aminotransferase  57.34 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147052  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  56.67 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1090  phosphoserine aminotransferase  57.34 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1395  phosphoserine aminotransferase  56.59 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.13819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  57.06 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  55.46 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  57.34 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  54.52 
 
 		 381 aa  401  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0982  phosphoserine aminotransferase  57.34 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0279153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  56.08 
 
 		 378 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4720  phosphoserine aminotransferase  56.01 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1036  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2987  phosphoserine aminotransferase  52.37 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  52.66 
 
 		 354 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  56.67 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  54.44 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  55.68 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  55.8 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  55.43 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1618  phosphoserine aminotransferase  55.34 
 
 		 377 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2465  phosphoserine aminotransferase  56.32 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.394582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  55.43 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  55.68 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  55.52 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1434  phosphoserine aminotransferase  54.17 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.860266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3281  phosphoserine aminotransferase  54.52 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0372795  normal  0.449595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3120  phosphoserine aminotransferase  55.07 
 
 		 381 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  55.4 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  55.4 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1538  phosphoserine aminotransferase  54.32 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0905864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2240  phosphoserine aminotransferase  56.59 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  52.79 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0639  phosphoserine aminotransferase  53.76 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2086  phosphoserine aminotransferase  51.69 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000931144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  51.25 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>