More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0979 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 
623 aa  1270  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  99.84 
 
 
608 aa  1238  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  51.24 
 
 
611 aa  614  1e-174  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  52.9 
 
 
607 aa  607  1e-172  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  51.16 
 
 
609 aa  603  1e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  52.01 
 
 
613 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  48.93 
 
 
607 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  48.6 
 
 
607 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  48.6 
 
 
607 aa  583  1e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  48.72 
 
 
657 aa  579  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  48.92 
 
 
608 aa  578  1e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  49.09 
 
 
608 aa  578  1e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  48.51 
 
 
607 aa  574  1e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  47.94 
 
 
607 aa  575  1e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  49.92 
 
 
626 aa  573  1e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  47.12 
 
 
607 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  48.18 
 
 
607 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  49.23 
 
 
585 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  3.75345e-08 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  46.77 
 
 
612 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  49.01 
 
 
607 aa  558  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  46.57 
 
 
613 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  47.42 
 
 
599 aa  552  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  45.81 
 
 
599 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  48.01 
 
 
603 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  46.17 
 
 
610 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.1646e-06  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  46 
 
 
610 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.90411e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  46 
 
 
610 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.3615e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  46 
 
 
610 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.00265e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  48.43 
 
 
605 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  46 
 
 
610 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.30785e-07  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  46 
 
 
610 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.78771e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  46.83 
 
 
610 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  3.87597e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
610 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  46.83 
 
 
610 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.94093e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
610 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  2.91711e-15 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  46 
 
 
610 aa  534  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.10405e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  46.45 
 
 
604 aa  534  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  46.5 
 
 
610 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  3.5589e-09 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  45.08 
 
 
610 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.70037e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  47.27 
 
 
606 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  45.16 
 
 
610 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  48 
 
 
598 aa  527  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  47.11 
 
 
619 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  46.43 
 
 
606 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  46.28 
 
 
607 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.23696e-05  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  45.26 
 
 
609 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  45.21 
 
 
609 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  44.96 
 
 
609 aa  524  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  45.33 
 
 
610 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  44.83 
 
 
610 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  44.7 
 
 
609 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  44.7 
 
 
609 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  44.7 
 
 
609 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  7.04584e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  45.29 
 
 
610 aa  518  1e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  44.54 
 
 
610 aa  517  1e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  1.62173e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  44.54 
 
 
609 aa  516  1e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  46.17 
 
 
588 aa  516  1e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.08036e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  44.54 
 
 
609 aa  517  1e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 
609 aa  516  1e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  44.17 
 
 
610 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  44.57 
 
 
609 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  44.37 
 
 
609 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.67064e-05  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  44.37 
 
 
609 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  45.49 
 
 
588 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.83054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  44.86 
 
 
608 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  44.08 
 
 
609 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 
609 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.85239e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  46.36 
 
 
621 aa  510  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  44.85 
 
 
617 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  44.85 
 
 
610 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.4144e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 
609 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  46.36 
 
 
627 aa  510  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02747  excinuclease ABC subunit C  45.83 
 
 
588 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  44.87 
 
 
608 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 
617 aa  506  1e-142  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.1478e-08  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  48.74 
 
 
614 aa  508  1e-142  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  44.85 
 
 
607 aa  505  1e-142  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  45.75 
 
 
657 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  45.8 
 
 
618 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  42.72 
 
 
639 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  45.96 
 
 
618 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  45.59 
 
 
657 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  47.34 
 
 
618 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1640  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 
609 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105988  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  45.21 
 
 
654 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  5.38512e-06  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  43.9 
 
 
617 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.1349e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  43.82 
 
 
609 aa  498  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  44.31 
 
 
673 aa  494  1e-138  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  44.94 
 
 
644 aa  492  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  41.96 
 
 
674 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2648  excinuclease ABC subunit C  42.5 
 
 
610 aa  488  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.473447  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  43.52 
 
 
631 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  43.52 
 
 
623 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0423  excinuclease ABC, C subunit  45.25 
 
 
618 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  43.36 
 
 
623 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  42.05 
 
 
700 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  43.92 
 
 
649 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  42.5 
 
 
635 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  41.63 
 
 
677 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 
684 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>