More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0881 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 364 aa  737    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 364 aa  737    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  58.54 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  55.43 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  56.02 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  55.06 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  56.06 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  56.06 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  60.76 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  56.06 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  55.21 
 
 		 368 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  55.46 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  55.46 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  56.34 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  56.06 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  55.46 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  56.34 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  54.49 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  56.06 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  55.77 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  54.93 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  55.9 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  55.87 
 
 		 365 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  55.49 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  51.69 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  53.22 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  55.03 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  54.75 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  54.75 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  56.34 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  55.03 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  54.65 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  55.46 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  53.63 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  51.26 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  52.25 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  52.38 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  52.53 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  52.71 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  55.98 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  53.37 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  52.11 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  52.11 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  51.83 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  52.21 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  54.14 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  54.34 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  54.34 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  55.21 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  53.76 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 358 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  55.4 
 
 		 370 aa  361  9e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  57.87 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  54.19 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 366 aa  359  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  54.47 
 
 		 367 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  54.34 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  51.39 
 
 		 368 aa  359  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  54 
 
 		 370 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  53.31 
 
 		 362 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  52.51 
 
 		 372 aa  358  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  53.89 
 
 		 358 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  55.62 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  51.12 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  53.31 
 
 		 362 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  53.31 
 
 		 362 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  53.31 
 
 		 362 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  53.31 
 
 		 362 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  51.4 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  53.6 
 
 		 366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  52.81 
 
 		 370 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  52.81 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  54.18 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  51.98 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  53.37 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  52.01 
 
 		 359 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  52.74 
 
 		 358 aa  349  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  55.17 
 
 		 362 aa  348  9e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  51.72 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  50.56 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  52.94 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  52.25 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 355 aa  342  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  51.74 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  54.6 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>