More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0782 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0481  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  685  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000244305  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3162  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.82 
 
 
658 aa  664  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  3.82924e-07 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2106  cytochrome-c oxidase  50.68 
 
 
668 aa  660  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.416073  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5010  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.41 
 
 
662 aa  661  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.035058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47190  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.64 
 
 
658 aa  649  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000419377  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0353  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.53 
 
 
663 aa  703  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2070  cytochrome-c oxidase  49.55 
 
 
668 aa  652  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976192  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5825  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.96 
 
 
666 aa  678  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.800495  normal  0.329958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3969  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.92 
 
 
668 aa  667  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873179  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0655  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.78 
 
 
665 aa  651  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1976  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.53 
 
 
668 aa  657  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0740  cytochrome-c oxidase  49.78 
 
 
665 aa  651  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00008  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.39 
 
 
666 aa  650  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4853  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.37 
 
 
667 aa  637  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.07 
 
 
665 aa  666  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115333  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0955  cytochrome-c oxidase  49.32 
 
 
659 aa  682  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1042  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.06 
 
 
663 aa  681  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0949  cytochrome c oxidase subunit I  48.73 
 
 
657 aa  644  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.979391  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5792  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.68 
 
 
658 aa  687  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  0.112215 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0268  ubiquinol oxidase, polypeptide I  45.71 
 
 
665 aa  644  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.764734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0500  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.08 
 
 
663 aa  685  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0037262  normal  0.500568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6007  cytochrome-c oxidase  49.55 
 
 
668 aa  652  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.46766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0544  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.08 
 
 
663 aa  685  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71096  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0489  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.08 
 
 
663 aa  685  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0274597  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3794  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.64 
 
 
658 aa  640  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622698  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3535  cytochrome c oxidase, subunit I  47.84 
 
 
676 aa  639  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5734  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.68 
 
 
667 aa  654  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0637775  normal  0.0130866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2089  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.55 
 
 
668 aa  652  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330323  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1089  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  49.7 
 
 
663 aa  693  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  9.53618e-06  hitchhiker  4.67486e-08 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2571  ubiquinol oxidase, subunit I  50.9 
 
 
670 aa  666  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0226  ubiquinol oxidase, subunit I  50.91 
 
 
668 aa  671  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0466  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.68 
 
 
663 aa  706  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000180375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0506  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.68 
 
 
663 aa  706  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.35927e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05492  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.18 
 
 
678 aa  645  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3099  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.62 
 
 
663 aa  682  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.284302  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0049  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  49.25 
 
 
659 aa  637  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4072  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.49 
 
 
658 aa  648  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0898  cytochrome-c oxidase  50 
 
 
663 aa  684  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00392168  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1095  cytochrome-c oxidase  65.86 
 
 
689 aa  894  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2773  ubiquinol oxidase, subunit I  50.3 
 
 
668 aa  656  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1210  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.15 
 
 
668 aa  658  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432825  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2715  ubiquinol oxidase, subunit I  51.06 
 
 
668 aa  672  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0985139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0471  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.68 
 
 
663 aa  706  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.17017e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3202  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.68 
 
 
663 aa  706  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154912  hitchhiker  0.000119789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3242  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  49.62 
 
 
663 aa  682  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0850  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.22 
 
 
672 aa  662  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1370  ubiquinol oxidase, subunit I  50.91 
 
 
668 aa  671  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.262769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0043  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.64 
 
 
659 aa  637  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1743  cytochrome-c oxidase  46.83 
 
 
668 aa  636  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0545412  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1567  ubiquinol oxidase, subunit I  50.91 
 
 
668 aa  671  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4375  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.52 
 
 
672 aa  668  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3061  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  49.62 
 
 
663 aa  682  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.88206e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2715  ubiquinol oxidase, subunit I  50.3 
 
 
668 aa  656  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0836  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.52 
 
 
672 aa  667  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.630143  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  49.85 
 
 
662 aa  668  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4047  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.43 
 
 
670 aa  643  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.354742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0632  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  100 
 
 
705 aa  1411  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.714863  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1859  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  50 
 
 
658 aa  672  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.113858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2916  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  49.7 
 
 
659 aa  657  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  0.149288 
 
 
-
 
NC_004310  BR0043  ubiquinol oxidase subunit I  48.8 
 
 
659 aa  640  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5375  cytochrome-c oxidase  49.4 
 
 
668 aa  647  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1326  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.43 
 
 
670 aa  640  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4647  cytochrome-c oxidase  48.06 
 
 
676 aa  649  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1391  normal  0.331546 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0992  ubiquinol oxidase, subunit I  51.06 
 
 
668 aa  672  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.502961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2834  ubiquinol oxidase polypeptide I  50.45 
 
 
668 aa  658  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3074  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  48.21 
 
 
663 aa  686  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000742797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00386  hypothetical protein  50.68 
 
 
663 aa  706  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2883  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.7 
 
 
663 aa  677  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0195  ubiquinol oxidase, subunit I  50.91 
 
 
668 aa  671  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6215  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  48.1 
 
 
667 aa  636  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0983  cytochrome-c oxidase  48.49 
 
 
657 aa  637  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0766124  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.75 
 
 
659 aa  666  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1142  cytochrome-c oxidase  48.43 
 
 
670 aa  647  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.303035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3270  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.76 
 
 
663 aa  682  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001554  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit I  47.68 
 
 
678 aa  641  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0480  ubiquinol oxidase, subunit I  50.91 
 
 
668 aa  672  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.070383  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0782  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 
716 aa  1434  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000788567  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1294  cytochrome-c oxidase  47.66 
 
 
659 aa  653  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0028015  hitchhiker  0.0019187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4578  cytochrome-c oxidase  49.4 
 
 
659 aa  664  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0515  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.68 
 
 
663 aa  706  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054228  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00382  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  50.68 
 
 
663 aa  706  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  5.24598e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0483  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.08 
 
 
663 aa  685  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0793094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0241  cytochrome-c oxidase  47.58 
 
 
669 aa  645  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515417  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0258  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.83 
 
 
664 aa  686  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0813  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.52 
 
 
672 aa  665  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0189476  normal  0.73245 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3178  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  50.68 
 
 
663 aa  706  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.36873e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1787  ubiquinol oxidase, subunit I  50.07 
 
 
670 aa  660  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1291  cytochrome-c oxidase  46.64 
 
 
664 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2285  cytochrome-c oxidase  48.48 
 
 
678 aa  629  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2031  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.74 
 
 
669 aa  631  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0504466  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4371  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  47.24 
 
 
669 aa  631  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7136  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  46.35 
 
 
667 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4777  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.6 
 
 
667 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315006  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5986  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  46.5 
 
 
667 aa  628  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3171  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  45.64 
 
 
666 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.404396  normal  0.0592526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1507  cytochrome-c oxidase  47.53 
 
 
672 aa  623  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.944776  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0596  cytochrome-c oxidase  46.83 
 
 
669 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4891  cytochrome-c oxidase  46.71 
 
 
667 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271265  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0223  cytochrome-c oxidase  46.46 
 
 
660 aa  621  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4336  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.07 
 
 
667 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>