239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0780 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  43.53 
 
 
231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3683  ThiJ/PfpI domain protein  39.91 
 
 
232 aa  158  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.93 
 
 
231 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.77 
 
 
233 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  40.6 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25350  putative intracellular protease/amidase  42.06 
 
 
232 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.34 
 
 
231 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  38.46 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23380  putative intracellular protease/amidase  41 
 
 
243 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254524  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  34.62 
 
 
227 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.74 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  35.9 
 
 
231 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 
231 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  37.77 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  36.75 
 
 
227 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.1 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  36.41 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  36.65 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  36.65 
 
 
230 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  35.74 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  35.9 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  34.57 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  35.9 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  35.32 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  35.9 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  35.9 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  35.9 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  35.9 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  35.9 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.01 
 
 
229 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.81 
 
 
284 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  36.41 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.47 
 
 
228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  36.82 
 
 
229 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.64 
 
 
232 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  35.47 
 
 
227 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.48 
 
 
225 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.45 
 
 
227 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.63 
 
 
230 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  35.78 
 
 
225 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  37.04 
 
 
233 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  32.2 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  33.62 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.2 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  34.33 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  34.05 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  31.76 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1831  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.55 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.34 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  34.62 
 
 
228 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5033  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1896  ThiJ/PfpI domain protein  31.25 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.815712  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.78 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.19 
 
 
228 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  32.19 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3191  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  35 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.7 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  33.05 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  33.78 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.49 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  35.59 
 
 
230 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  31.76 
 
 
267 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  32.03 
 
 
279 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  32.33 
 
 
225 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  30.77 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  30.99 
 
 
229 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  29.74 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.78 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.62 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  32.9 
 
 
226 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  32.62 
 
 
224 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  32.86 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.25 
 
 
229 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  34.23 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.32 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  31.49 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  34.36 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.76 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  34.4 
 
 
229 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  34.86 
 
 
228 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.86 
 
 
228 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  30.86 
 
 
279 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  34.75 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  33.91 
 
 
267 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.52 
 
 
227 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  32.08 
 
 
234 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.7 
 
 
230 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  32.72 
 
 
231 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  31.34 
 
 
933 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.78 
 
 
242 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  29 
 
 
223 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  30.33 
 
 
220 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  24.68 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  29.38 
 
 
219 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>