126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0708 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0708  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
191 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851081  hitchhiker  0.00000125723 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0553  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0989  hypothetical protein  55.19 
 
 
193 aa  207  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00594634  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1291  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.14 
 
 
193 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0446  redoxin domain-containing protein  48.65 
 
 
196 aa  191  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0232  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.47 
 
 
193 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0970667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1940  redoxin domain-containing protein  52.2 
 
 
217 aa  188  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1367  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  46.49 
 
 
185 aa  184  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.150367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1427  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.49 
 
 
185 aa  184  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0321  hypothetical protein  48.63 
 
 
182 aa  184  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2389  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.87 
 
 
187 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0343728  normal  0.47432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.69 
 
 
196 aa  181  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0955  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.95 
 
 
193 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1730  hypothetical protein  47.15 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1614  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.28 
 
 
188 aa  177  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4240  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.5 
 
 
193 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5009  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.84 
 
 
192 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4031  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.68 
 
 
191 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2478  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.86 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4302  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.21 
 
 
191 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.111782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11749  hypothetical protein  48.9 
 
 
182 aa  168  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.208132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3842  redoxin  45.6 
 
 
193 aa  168  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2915  hypothetical protein  47.57 
 
 
187 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00018662  normal  0.0183132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.81 
 
 
185 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3065  hypothetical protein  48.88 
 
 
186 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03161  hypothetical protein  43.32 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3487  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.2 
 
 
187 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0215  hypothetical protein  41.97 
 
 
194 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07195  hypothetical protein  42.39 
 
 
185 aa  158  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.825172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2156  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.4 
 
 
187 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1545  hypothetical protein  42.7 
 
 
185 aa  158  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1438  hypothetical protein  42.7 
 
 
185 aa  158  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0285  hypothetical protein  40.86 
 
 
197 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0678  hypothetical protein  46.11 
 
 
194 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182465  unclonable  0.0000000142494 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03061  hypothetical protein  38.95 
 
 
197 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0455  hypothetical protein  44.28 
 
 
203 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2194  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.3 
 
 
184 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502058  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0242  hypothetical protein  40.89 
 
 
222 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03071  hypothetical protein  39.78 
 
 
197 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25151  hypothetical protein  42.86 
 
 
221 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03101  hypothetical protein  39.5 
 
 
206 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.341385  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03631  hypothetical protein  39.02 
 
 
206 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0871591  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1461  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.65 
 
 
183 aa  148  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000703412  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0156  hypothetical protein  45.95 
 
 
186 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33412  normal  0.373382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1649  hypothetical protein  39.02 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2250  hypothetical protein  47.16 
 
 
188 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0243892  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2020  hypothetical protein  44.57 
 
 
185 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30864  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4022  redoxin domain-containing protein  42.93 
 
 
183 aa  140  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0884  hypothetical protein  42.22 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.231284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0378  hypothetical protein  43.24 
 
 
185 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0410  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.38 
 
 
183 aa  136  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0305173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0950  redoxin domain-containing protein  46.36 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626081  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2152  Redoxin domain protein  43.09 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.130156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0921  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.99 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2254  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.66 
 
 
188 aa  132  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0043335  normal  0.0136474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1408  redoxin domain-containing protein  40.12 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1889  hypothetical protein  45.6 
 
 
183 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000437946  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0234  hypothetical protein  42.93 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6604  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.34 
 
 
183 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0878  hypothetical protein  38.92 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0321  redoxin  41.95 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1342  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.46 
 
 
187 aa  125  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3587  hypothetical protein  43.15 
 
 
184 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.928293  normal  0.0457402 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3928  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.71 
 
 
188 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
184 aa  123  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2855  Redoxin domain protein  39.44 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0096  hypothetical protein  37.74 
 
 
194 aa  115  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1250  hypothetical protein  38.67 
 
 
190 aa  112  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0147  hypothetical protein  40.13 
 
 
193 aa  112  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1976  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  34.09 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.1 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1351  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.8 
 
 
186 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1318  redoxin domain-containing protein  33.7 
 
 
199 aa  104  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.845811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.41 
 
 
374 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3526  Redoxin domain protein  36.08 
 
 
196 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00360773  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  34.34 
 
 
377 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.89 
 
 
193 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0035  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.46 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
217 aa  91.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.527569  normal  0.0758496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0627  hypothetical protein  30.39 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.650522  normal  0.426152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06425  hypothetical protein  30.86 
 
 
213 aa  88.6  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.71 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4144  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.49 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5923  putative thiol-disulfide isomerase  30.29 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  30.19 
 
 
677 aa  72.4  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0067  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.66 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0757  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  24 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  34 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  28.35 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  30.83 
 
 
137 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.87 
 
 
598 aa  51.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  29.69 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2175  hypothetical protein  23.02 
 
 
160 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6629  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.14 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.23 
 
 
168 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  25 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  29.46 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  27.83 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3882  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.23 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15096  normal  0.0199402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>