234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0700 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  28.29 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  32.05 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  31.6 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  34.89 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  35.4 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  33.8 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  34.47 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  33.63 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  35.07 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  31.62 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.86 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  25.94 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  34.86 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  30.97 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  36.02 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  32.62 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  31.13 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  29.67 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  33.8 
 
 		 261 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  33.18 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  32.41 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  32 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  32.26 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  32.43 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  29.18 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  32.86 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  30.26 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  31.63 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  29.33 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.98 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  31.6 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  26.58 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  30.73 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  30.62 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  30.37 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  33.5 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  29.57 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  29.96 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  30.16 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1349  hypothetical protein  30.32 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  29.24 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  27.88 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.05 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  25.24 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.53 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  27.78 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  28.24 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  32.08 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2243  hypothetical protein  28.19 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  28.31 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.35 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  31.52 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.77 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  28.49 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  29.79 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5883  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4570  hypothetical protein  28.7 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00703325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0729  hypothetical protein  29.03 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151283  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  27.9 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.62 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  23.77 
 
 		 402 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.38 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  27.65 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  26.61 
 
 		 406 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.25 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0773  hypothetical protein  28.49 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  29.47 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.61 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.4 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  26.6 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  25.12 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  28.69 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  26.69 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  25.96 
 
 		 407 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  34.88 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.63 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  23.44 
 
 		 405 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  30.23 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 502 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>