234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0700 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.40392e-07  hitchhiker  9.02529e-10 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
290 aa  121  1e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  28.29 
 
 
253 aa  105  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  32.05 
 
 
254 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  31.6 
 
 
248 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  34.89 
 
 
271 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  35.4 
 
 
248 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  33.8 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  33.63 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  34.47 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  35.07 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.86 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  31.62 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  25.94 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  34.86 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  30.97 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  36.02 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  32.62 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  31.13 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  29.67 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  33.8 
 
 
261 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  33.18 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  32.41 
 
 
257 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  32 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  32.26 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
254 aa  85.1  1e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  32.43 
 
 
274 aa  85.1  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  29.18 
 
 
272 aa  84.7  2e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  32.86 
 
 
264 aa  84  2e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  30.26 
 
 
244 aa  83.6  4e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  31.63 
 
 
265 aa  82.8  5e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  29.33 
 
 
247 aa  82.8  6e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.98 
 
 
261 aa  82.4  7e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  31.6 
 
 
263 aa  81.3  2e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  30.73 
 
 
257 aa  80.9  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  26.58 
 
 
249 aa  80.9  2e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  30.62 
 
 
272 aa  79.3  6e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  30.37 
 
 
269 aa  78.2  1e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  33.5 
 
 
264 aa  76.6  4e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  29.57 
 
 
259 aa  75.9  7e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  29.96 
 
 
647 aa  75.1  1e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  30.16 
 
 
258 aa  72.4  8e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1349  hypothetical protein  30.32 
 
 
228 aa  70.1  4e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108709  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  29.24 
 
 
216 aa  69.7  5e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  9.54344e-08 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
275 aa  69.3  6e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  27.88 
 
 
214 aa  68.9  9e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.05 
 
 
248 aa  67.8  2e-10  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  25.24 
 
 
268 aa  66.6  4e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.53 
 
 
254 aa  65.5  1e-09  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  27.78 
 
 
216 aa  64.3  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  28.24 
 
 
281 aa  63.2  5e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  32.08 
 
 
260 aa  62  9e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.26151e-06  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2243  hypothetical protein  28.19 
 
 
217 aa  61.6  1e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  28.31 
 
 
252 aa  59.7  5e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  31.52 
 
 
213 aa  58.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.35 
 
 
257 aa  58.5  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.77 
 
 
255 aa  58.2  2e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  28.49 
 
 
213 aa  56.6  4e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4570  hypothetical protein  28.7 
 
 
211 aa  56.6  4e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00703325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  29.79 
 
 
213 aa  56.6  4e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5883  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
293 aa  56.6  4e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
294 aa  55.8  7e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
273 aa  54.7  2e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0729  hypothetical protein  29.03 
 
 
213 aa  53.9  3e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151283  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
272 aa  53.5  4e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  27.9 
 
 
269 aa  53.1  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.62 
 
 
237 aa  52.8  6e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 
265 aa  52.4  9e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.38 
 
 
274 aa  52  1e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.37661e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
274 aa  52  1e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  27.65 
 
 
409 aa  52  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  26.61 
 
 
406 aa  51.6  1e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  23.77 
 
 
402 aa  52  1e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.25 
 
 
282 aa  50.8  2e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0773  hypothetical protein  28.49 
 
 
212 aa  51.2  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225043  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  29.47 
 
 
222 aa  50.8  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.4 
 
 
246 aa  50.4  3e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.61 
 
 
259 aa  50.8  3e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.54 
 
 
253 aa  50.1  4e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
273 aa  50.1  4e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  26.6 
 
 
214 aa  50.1  4e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 
260 aa  49.7  5e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
320 aa  49.7  5e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  25.12 
 
 
253 aa  49.7  5e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 
281 aa  49.3  7e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
270 aa  48.9  9e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  25.96 
 
 
407 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  34.88 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  28.69 
 
 
317 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.63 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  36.36 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  26.69 
 
 
397 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5899  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  29.79 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  27.27 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0196e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>