More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0699 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.27096e-08  unclonable  2.92135e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  100 
 
 
96 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 
96 aa  154  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  1.27335e-12  n/a   
 
 
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  75 
 
 
96 aa  151  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  72.63 
 
 
96 aa  150  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
96 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
96 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  7.05596e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
96 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  146  1e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  145  2e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
127 aa  145  2e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  3.13463e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
95 aa  144  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.32343e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
96 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
95 aa  142  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 
97 aa  141  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
95 aa  141  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 
97 aa  141  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  141  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.35031e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 
97 aa  141  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
95 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 
96 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.96393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 
97 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
95 aa  139  1e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
96 aa  139  2e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
96 aa  137  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
96 aa  137  4e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  137  5e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  67.71 
 
 
96 aa  137  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
95 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 
104 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
96 aa  135  3e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 
96 aa  134  3e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  2.41636e-06  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.86758e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  134  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
95 aa  133  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
95 aa  133  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 
96 aa  132  1e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
95 aa  132  1e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 
96 aa  132  1e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 
96 aa  132  1e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.65316e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
96 aa  132  1e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 
96 aa  132  1e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 
95 aa  133  1e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  60 
 
 
96 aa  132  2e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 
97 aa  132  2e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 
105 aa  132  2e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 
96 aa  132  2e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
95 aa  132  2e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.9989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 
95 aa  132  2e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
95 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 
96 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.71869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  130  7e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
104 aa  130  7e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  65.62 
 
 
97 aa  130  7e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
105 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
105 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
105 aa  129  1e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
97 aa  129  1e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 
95 aa  129  1e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  129  1e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 
96 aa  129  1e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
98 aa  129  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  129  1e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
96 aa  129  1e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.3656e-11  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  129  1e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
97 aa  129  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 
104 aa  129  1e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 
105 aa  129  1e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
98 aa  129  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
104 aa  128  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 
96 aa  129  2e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
104 aa  128  2e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
98 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 
98 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  58.95 
 
 
105 aa  127  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
98 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  60.64 
 
 
106 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  58.95 
 
 
105 aa  127  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 
95 aa  127  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  58.95 
 
 
105 aa  127  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 
98 aa  127  4e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
104 aa  127  4e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 
95 aa  127  4e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 
95 aa  127  4e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
98 aa  127  5e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
105 aa  127  5e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
95 aa  127  5e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 
95 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 
121 aa  127  7e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  126  8e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
105 aa  127  8e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 
96 aa  126  9e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 
98 aa  126  9e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
105 aa  125  1e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
104 aa  126  1e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
104 aa  126  1e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
105 aa  125  1e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 
96 aa  125  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>