97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0697 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
189 aa  383  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
189 aa  383  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0694  phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
180 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2348  phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
178 aa  148  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1550  adenine phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 
176 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.314818  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0695  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
178 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2347  phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
180 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1567  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0847  phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
286 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0969821  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3242  phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178059  normal  0.212015 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4613  phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
233 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.490651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
190 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  28.32 
 
 
282 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  26.35 
 
 
280 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  29.81 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  25.38 
 
 
272 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  31.07 
 
 
278 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  25.38 
 
 
267 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3441  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
234 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665563  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  25.68 
 
 
274 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  22.73 
 
 
281 aa  52  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  27.93 
 
 
282 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  21.64 
 
 
270 aa  51.2  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  26.17 
 
 
274 aa  50.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  24.32 
 
 
273 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3151  phosphoribosyltransferase  29.24 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0150818  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  24.62 
 
 
267 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
177 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  25.93 
 
 
270 aa  48.5  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  24.24 
 
 
277 aa  48.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  25.58 
 
 
278 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  23.9 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  30.84 
 
 
274 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2104  adenine phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.52752  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  24.03 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  28.7 
 
 
272 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  25.24 
 
 
271 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
171 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1267  adenine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
230 aa  45.1  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1854  adenine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
230 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.787643 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  35.63 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  31 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  26.19 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  35.63 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  35.63 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0175  pur operon repressor  27.94 
 
 
275 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0230472  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  27.03 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  27.03 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  27.03 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  33.59 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
172 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
187 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
170 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
178 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  22.67 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
180 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  43.9 
 
 
227 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  26.81 
 
 
178 aa  41.2  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>