More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0687 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.11268e-05  hitchhiker  8.34379e-05 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  47.15 
 
 
136 aa  127  4e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  50.41 
 
 
140 aa  119  2e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  42.06 
 
 
137 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  42.86 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  44.54 
 
 
154 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  37.19 
 
 
155 aa  88.6  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
389 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  40 
 
 
161 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  44.54 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.09 
 
 
393 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  4.5135e-07  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  40.71 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.72 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  36.29 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.4 
 
 
361 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  40.68 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  42.61 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  37.9 
 
 
157 aa  83.2  1e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  1.71668e-05  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.9 
 
 
123 aa  83.2  1e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  39.2 
 
 
128 aa  80.9  5e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.68 
 
 
124 aa  80.9  6e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  39.52 
 
 
130 aa  80.5  7e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  41.32 
 
 
130 aa  80.5  8e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 
130 aa  79.7  1e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  41.74 
 
 
131 aa  78.6  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.87 
 
 
124 aa  79.3  2e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.30588e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  37.69 
 
 
354 aa  79  2e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
134 aa  77  8e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
145 aa  76.3  1e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  39.47 
 
 
126 aa  76.3  1e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
142 aa  75.5  2e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 
140 aa  75.9  2e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  37.4 
 
 
131 aa  74.7  4e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  36 
 
 
132 aa  74.7  4e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 
138 aa  74.7  4e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
128 aa  74.3  5e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  37.6 
 
 
323 aa  74.3  5e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 
136 aa  74.3  5e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  40.17 
 
 
133 aa  73.9  6e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  8.64682e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
155 aa  73.9  6e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  39.8 
 
 
137 aa  73.9  6e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 
129 aa  73.9  7e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  42.48 
 
 
125 aa  73.9  7e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
136 aa  73.6  9e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
126 aa  73.6  9e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  37.72 
 
 
130 aa  73.6  9e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  45.83 
 
 
130 aa  72.4  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 
119 aa  72.8  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.78 
 
 
131 aa  72  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
136 aa  72  2e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.61 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
123 aa  72.8  2e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  37.84 
 
 
141 aa  72  3e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 
141 aa  72  3e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  46.43 
 
 
356 aa  72  3e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  36.76 
 
 
141 aa  71.6  4e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  38.3 
 
 
140 aa  71.6  4e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 
127 aa  70.9  6e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
356 aa  70.5  7e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  39 
 
 
141 aa  70.5  7e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  3.98103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 
134 aa  70.1  9e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 
119 aa  70.1  1e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32.74 
 
 
133 aa  70.1  1e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 
125 aa  70.1  1e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.64 
 
 
356 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 
356 aa  69.3  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  40 
 
 
189 aa  69.3  2e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.44688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 
356 aa  68.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  34.91 
 
 
137 aa  69.3  2e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 
102 aa  69.3  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
119 aa  68.2  3e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 
140 aa  68.6  3e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
131 aa  68.2  3e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
130 aa  68.2  4e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
356 aa  67.8  4e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  39.64 
 
 
130 aa  67.8  5e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
356 aa  67.8  5e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  38.26 
 
 
119 aa  67.8  5e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  4.48823e-05 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  67.8  5e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  39.78 
 
 
140 aa  67.8  5e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  38.61 
 
 
389 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  29.46 
 
 
123 aa  67.4  6e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 
129 aa  67.4  6e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 
128 aa  67.4  7e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  29.46 
 
 
123 aa  67  9e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  41.05 
 
 
484 aa  66.6  1e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  37 
 
 
119 aa  66.2  1e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  41.05 
 
 
478 aa  66.6  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
141 aa  66.6  1e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  41.05 
 
 
484 aa  66.6  1e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  38.04 
 
 
280 aa  66.6  1e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.00812e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.05 
 
 
478 aa  66.6  1e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.05 
 
 
478 aa  66.6  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4822  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 
173 aa  66.6  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  40.45 
 
 
141 aa  65.5  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  32.8 
 
 
121 aa  65.9  2e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>