49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0686 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  312  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  312  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.36633e-05  hitchhiker  8.90362e-05 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  35.06 
 
 
147 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  38.89 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  34.97 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  31.47 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  34.48 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  31.62 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  35.38 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  36 
 
 
148 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  33.56 
 
 
149 aa  78.6  3e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  39.34 
 
 
148 aa  78.2  3e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  33.11 
 
 
155 aa  75.1  3e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  34.81 
 
 
144 aa  73.9  6e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  31.65 
 
 
143 aa  73.6  1e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  31.72 
 
 
146 aa  72  3e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  31.21 
 
 
148 aa  69.3  2e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  65.5  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  27.86 
 
 
167 aa  60.5  7e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  29.86 
 
 
148 aa  59.3  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  28.29 
 
 
184 aa  57.4  7e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  28.99 
 
 
153 aa  56.6  1e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  26.57 
 
 
118 aa  53.1  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  25.83 
 
 
172 aa  51.6  3e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  30.61 
 
 
149 aa  52  3e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  28.28 
 
 
138 aa  51.2  5e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  48.9  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  23.45 
 
 
153 aa  49.3  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  29.79 
 
 
148 aa  49.3  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  29.25 
 
 
149 aa  49.3  2e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  29.14 
 
 
163 aa  49.3  2e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  29.29 
 
 
132 aa  48.5  3e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  27.74 
 
 
151 aa  48.5  3e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  28.28 
 
 
148 aa  47  8e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  47  9e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  31.52 
 
 
111 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  27.07 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3881  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  0.573766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  25.9 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  25.18 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  29.66 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  30.7 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  28.12 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  28.28 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  25 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5065  Host attachment protein  24.79 
 
 
166 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.839567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  34.21 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>