81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0575 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0575  addiction module toxin, Txe/YoeB family  100 
 
 
58 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0412  addiction module toxin, Txe/YoeB family  100 
 
 
58 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0555  toxin  62.07 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2447  addiction module antitoxin  56.9 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1207  addiction module toxin, Txe/YoeB  62.07 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.927774  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5408  addiction module antitoxin  58.62 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4766  addiction module antitoxin  56.9 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4878  addiction module antitoxin  56.9 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3488  addiction module toxin, Txe/YoeB  56.9 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0843  addiction module toxin, Txe/YoeB  56.9 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0391  addiction module toxin, Txe/YoeB family  58.62 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3815  hypothetical protein  56.9 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2859  addiction module toxin, Txe/YoeB family  56.9 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1307  addiction module toxin, Txe/YoeB  58.62 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1401  addiction module antitoxin  55.17 
 
 
87 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1926  addiction module toxin, Txe/YoeB family  55.17 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4433  addiction module antitoxin  55.17 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.322385  normal  0.385628 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  61.82 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  61.82 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3893  addiction module toxin, Txe/YoeB family  55.17 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1844  hypothetical protein  51.72 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.891967  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2537  addiction module toxin, Txe/YoeB family  58.18 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3569  addiction module toxin, Txe/YoeB family  58.18 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359061  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3904  addiction module antitoxin  50 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256744  normal  0.0837513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13394  hypothetical protein  58.18 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0756561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1215  toxin YoeB  51.72 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2308  toxin YoeB  51.72 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.528458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2599  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.72 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2091  RelE  50 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.347779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1640  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.72 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0526904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2155  addiction module toxin component YoeB  51.72 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1940  addiction module toxin, Txe/YoeB family  53.45 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4635  addiction module toxin, Txe/YoeB  48.28 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242001  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2294  addiction module toxin, Txe/YoeB family  50 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0193925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4022  addiction module antitoxin  48.28 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  53.45 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0312  addiction module antitoxin  53.57 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0432  hypothetical protein  53.45 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0793  addiction module antitoxin  48.28 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2026  addiction module toxin, Txe/YoeB family  53.45 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0336  hypothetical protein  51.72 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.689811  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01340  toxin-antitoxin system, toxin component, Txe/YoeB family  50 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0988  addiction module antitoxin  51.72 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0246  addiction module toxin, Txe/YoeB family  50 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1662  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48.28 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0202081 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  52.94 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16290  addiction module toxin, Txe/YoeB family  46.55 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3299  addiction module toxin Txe/YoeB family  48.39 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1700  addiction module antitoxin  52.73 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0662  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0027  addiction module toxin, Txe/YoeB  46.77 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0189649  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2721  addiction module antitoxin  57.14 
 
 
62 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284593  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  50.91 
 
 
233 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  46.55 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1753  addiction module antitoxin  49.15 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.709667  normal  0.0794356 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4121  hypothetical protein  48.39 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2556  addiction module toxin, Txe/YoeB  52.54 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307298  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2605  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48.28 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.564887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16050  toxin-antitoxin system, toxin component, Txe/YoeB family  48.28 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1523  addiction module toxin, Txe/YoeB family  44.83 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.370643  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2008  hypothetical protein  46.55 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0280496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0408  addiction module antitoxin  47.27 
 
 
86 aa  59.3  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2431  Txe/YoeB family addiction module toxin  47.27 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4647  addiction module toxin, Txe/YoeB family  45.45 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00453645  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0392  hypothetical protein  49.15 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0040336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0737  hypothetical protein  53.33 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000370913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2532  addiction module toxin, Txe/YoeB family  45.45 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2479  addiction module antitoxin  44.07 
 
 
63 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1840  hypothetical protein  44.83 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.185437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2536  addiction module toxin, Txe/YoeB family  43.64 
 
 
81 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1659  addiction module toxin Txe/YoeB  69.7 
 
 
36 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2088  addiction module toxin, Txe/YoeB  41.07 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000111653  unclonable  0.0000000950728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2038  addiction module antitoxin  40.74 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2573  addiction module toxin, Txe/YoeB family  42.37 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000405967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0231  addiction module antitoxin  42 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1100  addiction module toxin, Txe/YoeB  37.93 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3884  addiction module toxin, Txe/YoeB family  41.82 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1930  addiction module toxin, Txe/YoeB  38.78 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2586  addiction module toxin, Txe/YoeB family  38.78 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0726  addiction module toxin, Txe/YoeB family  44.9 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1443  addiction module toxin, Txe/YoeB family  41.51 
 
 
92 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.403552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>