28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0533 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  78.4 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  77.6 
 
 		 122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  48.8 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  45.6 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  49.55 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  34.96 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  28.8 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2712  hypothetical protein  32.54 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.548763  unclonable  0.0000000000219887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3114  hypothetical protein  32.54 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  32.69 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  29.91 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  34.75 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  32.11 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  36.44 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  36.44 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1808  hypothetical protein  23.58 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00352059  normal  0.289131 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  29.17 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  31.2 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  29.84 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  29.01 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  31.71 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  30.12 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  36.84 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>