More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0518 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  99.54 
 
 
218 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  48.58 
 
 
214 aa  224  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  48.82 
 
 
215 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  49.49 
 
 
217 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  43.96 
 
 
216 aa  215  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  43.96 
 
 
216 aa  215  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  46.19 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  50.71 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  48.31 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  43.72 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  47.49 
 
 
217 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  48.82 
 
 
214 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  50 
 
 
211 aa  209  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  49.29 
 
 
214 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  45.67 
 
 
213 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  47.95 
 
 
218 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.52 
 
 
215 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  56.25 
 
 
218 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  44.44 
 
 
216 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.23 
 
 
220 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  47.2 
 
 
217 aa  208  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  44.55 
 
 
217 aa  207  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  47.6 
 
 
216 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  46.23 
 
 
217 aa  207  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  46.92 
 
 
216 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  46.45 
 
 
217 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  46.45 
 
 
217 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  41.04 
 
 
215 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  46.23 
 
 
217 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  47.49 
 
 
218 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  45.28 
 
 
215 aa  205  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  46.92 
 
 
216 aa  205  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  46.92 
 
 
215 aa  205  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1541  adenylate kinase  46.15 
 
 
218 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0259287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  43.48 
 
 
216 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  45.09 
 
 
222 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  46.15 
 
 
216 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  45.09 
 
 
222 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  42.86 
 
 
217 aa  204  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  47.47 
 
 
222 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  46.64 
 
 
220 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  43.4 
 
 
423 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.17 
 
 
211 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  47.49 
 
 
218 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  44.08 
 
 
214 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  40.57 
 
 
215 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  46.12 
 
 
218 aa  202  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  47.09 
 
 
220 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  40.57 
 
 
215 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  47.09 
 
 
220 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  40.76 
 
 
214 aa  202  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  48.2 
 
 
215 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  46.64 
 
 
215 aa  201  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1362  adenylate kinase  45.45 
 
 
218 aa  201  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  45.54 
 
 
221 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  46.76 
 
 
218 aa  201  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  46.15 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1510  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.91 
 
 
218 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  45.02 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  42.45 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  45.91 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  47.89 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  45.97 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  45.75 
 
 
228 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  47.09 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  47.09 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  45.54 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  44.64 
 
 
221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  43.98 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1366  adenylate kinase  45 
 
 
218 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  46.12 
 
 
221 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.86 
 
 
219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  46.51 
 
 
224 aa  198  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  47.03 
 
 
218 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  47.75 
 
 
215 aa  197  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  46.48 
 
 
222 aa  197  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  43.4 
 
 
213 aa  197  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  47.89 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  47.89 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  44.75 
 
 
218 aa  197  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  44.75 
 
 
218 aa  197  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  46.4 
 
 
215 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  45.29 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  46.4 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  45.24 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  46.82 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  44.83 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  44.2 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  44.75 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>