More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0494 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3716  elongation factor G  67.19 
 
 
704 aa  947  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0927216  normal  0.0969109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  69.19 
 
 
703 aa  971  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47912e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  68.76 
 
 
700 aa  994  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  69.68 
 
 
700 aa  986  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.9839e-09  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  71.41 
 
 
700 aa  1009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2192  elongation factor G  66.01 
 
 
705 aa  943  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.857068  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  69.9 
 
 
703 aa  978  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  68.9 
 
 
700 aa  995  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4693  elongation factor G  66.95 
 
 
698 aa  959  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.36363e-06  unclonable  6.46786e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4752  elongation factor G  64.89 
 
 
714 aa  964  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0168923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  66.19 
 
 
703 aa  972  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  67.48 
 
 
704 aa  966  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.94361e-06  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  59.77 
 
 
695 aa  847  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  67.48 
 
 
704 aa  966  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.19107e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  67.38 
 
 
702 aa  968  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.12388e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  60.78 
 
 
689 aa  887  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0803  elongation factor G  60.55 
 
 
692 aa  867  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.468644  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2102  elongation factor G  66.01 
 
 
705 aa  943  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.990923  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  69.13 
 
 
701 aa  978  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  69.19 
 
 
700 aa  1004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  66.57 
 
 
713 aa  953  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  63.32 
 
 
704 aa  928  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  63.38 
 
 
704 aa  944  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3670  elongation factor G  60.78 
 
 
690 aa  870  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  64.38 
 
 
704 aa  947  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  66.86 
 
 
692 aa  980  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  63.86 
 
 
704 aa  934  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.62154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  61.33 
 
 
693 aa  887  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  62.55 
 
 
691 aa  929  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  66.09 
 
 
690 aa  934  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  68.29 
 
 
723 aa  997  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  68.76 
 
 
700 aa  997  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.46434e-05  hitchhiker  4.15866e-10 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  68.66 
 
 
701 aa  976  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  69.44 
 
 
700 aa  957  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  67.48 
 
 
704 aa  966  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.97299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  60.43 
 
 
700 aa  877  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  66.05 
 
 
706 aa  972  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0481  elongation factor G  65.03 
 
 
714 aa  972  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0301247  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  66.09 
 
 
689 aa  942  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  68.35 
 
 
699 aa  971  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  63.35 
 
 
701 aa  892  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  69.78 
 
 
699 aa  1034  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  63.79 
 
 
691 aa  901  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  64.27 
 
 
692 aa  932  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  66.05 
 
 
691 aa  949  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  67.38 
 
 
702 aa  968  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.96872e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  64.8 
 
 
691 aa  946  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  67.34 
 
 
697 aa  978  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  63.32 
 
 
692 aa  915  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  66.67 
 
 
698 aa  988  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.38252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  67.38 
 
 
730 aa  986  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  67.33 
 
 
706 aa  968  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  66.09 
 
 
697 aa  966  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  6.2878e-06  unclonable  9.8696e-12 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  60.06 
 
 
693 aa  849  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  7.68044e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  60.43 
 
 
691 aa  872  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  2.19808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  67.48 
 
 
704 aa  966  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  67.48 
 
 
704 aa  966  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  67.39 
 
 
698 aa  952  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.82121e-06  unclonable  2.47136e-10 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  63.32 
 
 
692 aa  914  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  67.38 
 
 
702 aa  968  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.79981e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  69.93 
 
 
699 aa  1035  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  69.7 
 
 
701 aa  981  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20192e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  69.33 
 
 
700 aa  998  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  68.9 
 
 
700 aa  990  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  69.01 
 
 
702 aa  966  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  60.37 
 
 
705 aa  880  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  66.67 
 
 
698 aa  988  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  60.32 
 
 
691 aa  863  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  61.79 
 
 
701 aa  869  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  59.83 
 
 
698 aa  853  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  60.78 
 
 
698 aa  859  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  67.53 
 
 
698 aa  971  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.44622e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  65.91 
 
 
704 aa  952  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  66.28 
 
 
701 aa  947  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  68.14 
 
 
709 aa  988  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.11702e-07  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  62.09 
 
 
692 aa  905  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  61.06 
 
 
689 aa  905  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  63.32 
 
 
691 aa  926  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  66.48 
 
 
691 aa  963  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  62.63 
 
 
705 aa  880  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  7.93105e-13 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  60.91 
 
 
698 aa  862  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.82661e-07  hitchhiker  1.23904e-06 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  58.88 
 
 
699 aa  858  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  61.64 
 
 
689 aa  898  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  57.39 
 
 
690 aa  851  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  62.57 
 
 
700 aa  899  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  1.70843e-05  decreased coverage  8.39395e-11 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  62.27 
 
 
691 aa  914  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1612  translation elongation factor G  57.98 
 
 
715 aa  848  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  59.66 
 
 
705 aa  848  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  63.17 
 
 
695 aa  900  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  66.24 
 
 
692 aa  964  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3828  elongation factor G  66.33 
 
 
704 aa  940  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000816604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0318  elongation factor G  66.38 
 
 
704 aa  948  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000130884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  63.85 
 
 
690 aa  929  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  65.09 
 
 
689 aa  935  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4007  elongation factor G  66.62 
 
 
704 aa  942  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.80538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  58.71 
 
 
700 aa  848  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  62.39 
 
 
693 aa  899  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.03063e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  61.01 
 
 
697 aa  856  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  70.44 
 
 
698 aa  1028  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  60.06 
 
 
699 aa  852  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>