More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0446 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  57.96 
 
 		 361 aa  275  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  58.22 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  57.89 
 
 		 228 aa  254  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  55.75 
 
 		 242 aa  248  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  52.61 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  51.09 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  51.09 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  59.21 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  53.88 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  52.61 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  52.4 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  55.22 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.56 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  50.22 
 
 		 245 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  50 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  48.68 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  50.88 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  50.88 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  49.12 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  48.67 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  49.56 
 
 		 356 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  49.56 
 
 		 356 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  49.12 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  49.56 
 
 		 356 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  49.13 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  49.78 
 
 		 345 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  47.37 
 
 		 357 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  46.9 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  48.89 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  47.11 
 
 		 346 aa  204  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  45.65 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  46.09 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  48.44 
 
 		 344 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  49.56 
 
 		 356 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  49.56 
 
 		 356 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  49.56 
 
 		 356 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  46.02 
 
 		 249 aa  201  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  46.22 
 
 		 346 aa  201  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  40.89 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  42.06 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  44 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  40.44 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  44 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.37 
 
 		 357 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  43.56 
 
 		 346 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36 
 
 		 354 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 		 297 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  34.76 
 
 		 237 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  31.06 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  35.48 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 251 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  32.32 
 
 		 288 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 298 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  33.08 
 
 		 287 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  44.03 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  30.15 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  30.71 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 		 466 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.64 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  30.38 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 290 aa  111  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 288 aa  111  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  31.56 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  31.92 
 
 		 431 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  32.32 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.95 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  38.38 
 
 		 463 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  29.66 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  32.06 
 
 		 426 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.09 
 
 		 471 aa  108  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.91 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  33.2 
 
 		 455 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 		 296 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 306 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 461 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  29.66 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>