More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0432 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 243 aa  427  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  37.56 
 
 		 214 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  35.25 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  27.88 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  26.06 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.55 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.55 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.55 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
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NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
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NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.55 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
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NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
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NC_008781  Pnap_4037  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.766436 
 
 
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NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
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NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
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NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  37.1 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
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