More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0409 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 315 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 315 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  35.74 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  29.53 
 
 		 652 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 282 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 616 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 314 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 624 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 841 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 679 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.16 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 705 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  26.47 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  27.66 
 
 		 330 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 340 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.47 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  27.16 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 378 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  21.45 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  23.1 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.41 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 714 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 1267 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>