More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0391 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
594 aa  1199    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  100 
 
 
594 aa  1199    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2515  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.48 
 
 
584 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.678179  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2895  peptidoglycan synthetase FtsI , putative  49.48 
 
 
584 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.06 
 
 
571 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.81 
 
 
570 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  42.41 
 
 
552 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  41.56 
 
 
579 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  42.36 
 
 
548 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  41.56 
 
 
579 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.03 
 
 
614 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  41.78 
 
 
622 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  40.37 
 
 
553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  40.19 
 
 
576 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  39.5 
 
 
621 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  38.86 
 
 
579 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  40.38 
 
 
575 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  40.37 
 
 
553 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  39.53 
 
 
583 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.32 
 
 
621 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  39.57 
 
 
624 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  39.16 
 
 
578 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  41.32 
 
 
578 aa  402  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  39.49 
 
 
575 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 
615 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  41.5 
 
 
570 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  36.96 
 
 
580 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  38.78 
 
 
615 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  39.47 
 
 
575 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 
616 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 
615 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 
615 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  38.21 
 
 
583 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 
613 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  38.42 
 
 
614 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 
615 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 
615 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 
613 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 
588 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 
582 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  37.88 
 
 
614 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  38.2 
 
 
597 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 
582 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 
578 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  37.88 
 
 
614 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  36.56 
 
 
582 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  40.4 
 
 
577 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  37.88 
 
 
614 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 
577 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  37.88 
 
 
614 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  37.88 
 
 
614 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  40.23 
 
 
587 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  37.88 
 
 
614 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  37.88 
 
 
614 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  41.17 
 
 
575 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 
580 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  40.14 
 
 
587 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  37.94 
 
 
601 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 
614 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  37.48 
 
 
595 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  37.7 
 
 
594 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  40.58 
 
 
581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  37.74 
 
 
594 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  40.58 
 
 
581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  40.58 
 
 
581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  40.58 
 
 
581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  40.58 
 
 
581 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  37.81 
 
 
594 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  37.81 
 
 
594 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  37.81 
 
 
594 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  38.41 
 
 
578 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  37.32 
 
 
596 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  38.86 
 
 
568 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  37.46 
 
 
605 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  37.81 
 
 
594 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  37.81 
 
 
594 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  37.01 
 
 
581 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.34 
 
 
595 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 
580 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  36.38 
 
 
577 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  40.15 
 
 
570 aa  369  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  38.25 
 
 
565 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  38.73 
 
 
578 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  37.7 
 
 
577 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.16 
 
 
595 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  36.02 
 
 
578 aa  365  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 
587 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 
578 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  36.85 
 
 
582 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  37.89 
 
 
565 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 
587 aa  362  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  39.54 
 
 
588 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 
587 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.28 
 
 
577 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  37.68 
 
 
587 aa  360  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  37.68 
 
 
587 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  37.68 
 
 
587 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  37.52 
 
 
588 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  37.75 
 
 
600 aa  360  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>