More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0349 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 579 aa  1180    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 579 aa  1180    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 586 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 611 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 586 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 587 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 588 aa  609  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 592 aa  598  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 589 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 589 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 584 aa  593  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 587 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 598 aa  587  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 587 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 585 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 592 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 586 aa  565  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 609 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 609 aa  531  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 554 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 554 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 551 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 559 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 551 aa  475  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 563 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 551 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 557 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 551 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 556 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 556 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 556 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 556 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 556 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 556 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 556 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 562 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 560 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 562 aa  445  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 550 aa  445  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 562 aa  445  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 550 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 562 aa  438  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 564 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 563 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 575 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 553 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 546 aa  422  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 546 aa  422  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 553 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 556 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 564 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 557 aa  419  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 553 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 564 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0903  arginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 580 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 570 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 605 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 565 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 581 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 577 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>