More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0311 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0138  LPS heptosyltransferase II  99.73 
 
 
369 aa  739  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0311  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  100 
 
 
376 aa  754  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  2.8657e-05 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  49.09 
 
 
343 aa  316  5e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  49.09 
 
 
343 aa  315  1e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  51.06 
 
 
362 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  44.14 
 
 
334 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  44.57 
 
 
356 aa  291  9e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  44.57 
 
 
356 aa  291  9e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0768  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  46.06 
 
 
346 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  48.94 
 
 
356 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  45.81 
 
 
344 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  44.28 
 
 
352 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  47.43 
 
 
349 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  49.7 
 
 
353 aa  284  2e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  44.91 
 
 
344 aa  283  3e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  45.59 
 
 
344 aa  283  4e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  47.88 
 
 
349 aa  282  7e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  46.13 
 
 
347 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  46.25 
 
 
349 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  46.25 
 
 
349 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  46.25 
 
 
349 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  43.79 
 
 
346 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  43.11 
 
 
352 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  45.95 
 
 
349 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  45.87 
 
 
337 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  45.81 
 
 
345 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  45.51 
 
 
345 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.27 
 
 
343 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.62 
 
 
335 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  46.94 
 
 
351 aa  252  8e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.12 
 
 
354 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.12 
 
 
354 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.12 
 
 
354 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  42.01 
 
 
348 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  41.81 
 
 
346 aa  246  6e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.71 
 
 
354 aa  244  2e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  42.22 
 
 
341 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  42.6 
 
 
349 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.76 
 
 
348 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.11589e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  42.31 
 
 
355 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.76 
 
 
348 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.76 
 
 
348 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.76456e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.76 
 
 
348 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.76 
 
 
348 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  9.10947e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.76 
 
 
348 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.76 
 
 
348 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  40.71 
 
 
348 aa  240  3e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  1.23646e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.47 
 
 
348 aa  240  3e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.8978e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.32 
 
 
341 aa  240  3e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.71 
 
 
348 aa  240  3e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  2.5219e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  41.44 
 
 
341 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.41 
 
 
348 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.41 
 
 
348 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.41 
 
 
348 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.41 
 
 
348 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  42.01 
 
 
350 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3947  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  41.42 
 
 
350 aa  236  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  40.41 
 
 
348 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  42.23 
 
 
346 aa  234  1e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  42.82 
 
 
346 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  42.26 
 
 
341 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.02 
 
 
340 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  42.14 
 
 
341 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  42.23 
 
 
346 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  42.23 
 
 
346 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  42.23 
 
 
346 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  42.23 
 
 
376 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  41.54 
 
 
341 aa  226  5e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  42.23 
 
 
346 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  42.23 
 
 
346 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  39.29 
 
 
343 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.76 
 
 
345 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.76 
 
 
345 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.47 
 
 
345 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.47 
 
 
345 aa  222  1e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.46 
 
 
358 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.16 
 
 
358 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.1 
 
 
329 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.41 
 
 
329 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.87 
 
 
346 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  41.1 
 
 
329 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.79 
 
 
358 aa  201  1e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  39.44 
 
 
359 aa  198  1e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  39.07 
 
 
331 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  39.71 
 
 
341 aa  191  3e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.7 
 
 
356 aa  179  6e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.62 
 
 
357 aa  174  3e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  34.36 
 
 
354 aa  165  2e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.85 
 
 
317 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.21 
 
 
359 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3550  putative adp-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  35.61 
 
 
342 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.83 
 
 
314 aa  141  1e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.71 
 
 
343 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.1 
 
 
352 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.08 
 
 
304 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.59 
 
 
359 aa  128  2e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  33.54 
 
 
356 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.58 
 
 
317 aa  120  4e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.44 
 
 
316 aa  120  5e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  26.82 
 
 
327 aa  118  2e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.37815e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>