238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0309 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  3.16331e-05 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  3.29494e-06 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36372e-09 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  5.40383e-10 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  897  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2239  hypothetical protein  47.17 
 
 
295 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.927894  hitchhiker  0.000636864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  37.56 
 
 
390 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  44.86 
 
 
395 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  42.59 
 
 
390 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  42.59 
 
 
390 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  42.59 
 
 
390 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  37.39 
 
 
404 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  36.94 
 
 
433 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  36.94 
 
 
409 aa  118  2e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  38.86 
 
 
367 aa  118  2e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  38.86 
 
 
395 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 
395 aa  115  2e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  33.33 
 
 
396 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  33.33 
 
 
396 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  33.33 
 
 
396 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  33.33 
 
 
396 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  33.33 
 
 
396 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  33.33 
 
 
396 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  34.31 
 
 
331 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  33.72 
 
 
437 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  31.71 
 
 
401 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  31.71 
 
 
401 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  32.83 
 
 
372 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  32.83 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  32.32 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0246  transposase, IS4 family protein  30.05 
 
 
367 aa  87  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1030  hypothetical protein  33.16 
 
 
207 aa  86.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3188  hypothetical protein  33.16 
 
 
207 aa  86.3  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0815564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
381 aa  82.4  2e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
381 aa  82.4  2e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  30.98 
 
 
415 aa  82  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
381 aa  82.4  2e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  26.79 
 
 
374 aa  80.1  8e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  29.7 
 
 
248 aa  79.7  9e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  29.7 
 
 
248 aa  79.7  9e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  26.79 
 
 
374 aa  79.7  9e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1061  ISPg6, transposase  30.54 
 
 
362 aa  79.3  1e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  26.29 
 
 
374 aa  79  2e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1350  ISPg2, transposase  30.77 
 
 
376 aa  79  2e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1746  ISPg2, transposase  30.77 
 
 
376 aa  79  2e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0865  ISPg2, transposase  30.77 
 
 
376 aa  79  2e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  26.29 
 
 
374 aa  79  2e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0277  ISPg2, transposase  30.77 
 
 
376 aa  79  2e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  28.5 
 
 
377 aa  79  2e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2176  ISPg2, transposase  30.77 
 
 
376 aa  79  2e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1127  transposase, IS4  26.29 
 
 
290 aa  78.2  3e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  26.87 
 
 
230 aa  77  5e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 
377 aa  76.6  8e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  30.04 
 
 
483 aa  75.9  1e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  26.94 
 
 
374 aa  76.3  1e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  28.04 
 
 
373 aa  76.3  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>