More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0183 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  38.08 
 
 		 1023 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  53.32 
 
 		 1064 aa  951    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  38.4 
 
 		 1039 aa  669    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.34 
 
 		 1028 aa  930    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  54.3 
 
 		 1061 aa  949    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  40.56 
 
 		 1045 aa  690    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.64 
 
 		 1071 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  39.47 
 
 		 1031 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  39.09 
 
 		 1034 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  38.85 
 
 		 1041 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.64 
 
 		 1092 aa  674    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  53.6 
 
 		 1064 aa  963    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  58.13 
 
 		 1039 aa  1081    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  37.94 
 
 		 1054 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  53.18 
 
 		 1054 aa  977    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.66 
 
 		 1034 aa  644    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  53.31 
 
 		 1064 aa  946    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  51.93 
 
 		 1046 aa  994    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.28 
 
 		 1061 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  55.56 
 
 		 1052 aa  1070    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1032 aa  2032    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  51.88 
 
 		 1055 aa  863    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.12 
 
 		 1066 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 		 1040 aa  632  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.21 
 
 		 1048 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.12 
 
 		 1066 aa  629  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  37.9 
 
 		 1036 aa  624  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.5 
 
 		 1053 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  42.22 
 
 		 1033 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.28 
 
 		 1049 aa  618  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  39.07 
 
 		 1043 aa  619  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  38.8 
 
 		 1043 aa  618  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.85 
 
 		 1054 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.34 
 
 		 1049 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.65 
 
 		 1026 aa  612  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.88 
 
 		 1037 aa  609  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.37 
 
 		 1049 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.3 
 
 		 1037 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  38.93 
 
 		 1058 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  36.84 
 
 		 1039 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  38.28 
 
 		 1049 aa  602  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  38.64 
 
 		 1066 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  38.73 
 
 		 1058 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  37.49 
 
 		 1047 aa  595  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.64 
 
 		 1039 aa  595  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  36.95 
 
 		 1050 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  37.74 
 
 		 1075 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.33 
 
 		 1039 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.35 
 
 		 1039 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.23 
 
 		 1039 aa  588  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.33 
 
 		 1039 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  35.4 
 
 		 1039 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  35.78 
 
 		 1039 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  38.22 
 
 		 1047 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  36.21 
 
 		 1043 aa  572  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.97 
 
 		 1048 aa  572  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1052 aa  558  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  42.68 
 
 		 1034 aa  558  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  39.34 
 
 		 1030 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1044 aa  535  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1057 aa  526  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  33.3 
 
 		 1049 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  33.37 
 
 		 1052 aa  519  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.33 
 
 		 1052 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  33.1 
 
 		 1029 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.88 
 
 		 1034 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.03 
 
 		 1020 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  33.49 
 
 		 1064 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  32.95 
 
 		 1070 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  32.86 
 
 		 1070 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.4 
 
 		 1049 aa  501  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.53 
 
 		 1051 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  32.34 
 
 		 1032 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  32.67 
 
 		 1070 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  31.88 
 
 		 1059 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.2 
 
 		 1034 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  32.67 
 
 		 1083 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  32.76 
 
 		 1070 aa  499  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  32.76 
 
 		 1070 aa  499  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.4 
 
 		 1034 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  33.04 
 
 		 1032 aa  496  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  32.92 
 
 		 1047 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  33.15 
 
 		 1077 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  33.11 
 
 		 1031 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.24 
 
 		 1043 aa  495  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  32.52 
 
 		 1077 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  32.52 
 
 		 1077 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  32.52 
 
 		 1077 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  32.91 
 
 		 1046 aa  492  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  32.37 
 
 		 1033 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  33.21 
 
 		 1053 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  32.42 
 
 		 1077 aa  489  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.31 
 
 		 1063 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  32.33 
 
 		 1077 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  32.33 
 
 		 1077 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  31.21 
 
 		 1063 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  32.33 
 
 		 1077 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  31.57 
 
 		 1034 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.17 
 
 		 1047 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  32.01 
 
 		 1053 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>