More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0159 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  97.78 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  60.63 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  65.6 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  59.09 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  63.2 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  62.4 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  62.4 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 135 aa  157  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  59.52 
 
 		 144 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  59.52 
 
 		 144 aa  156  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  58.73 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  58.27 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  58.2 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  59.52 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  58.14 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  57.94 
 
 		 162 aa  151  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  57.94 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  57.14 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  57.94 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  57.94 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  57.94 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  57.94 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  57.94 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  44.88 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  41.6 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.4 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.15 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  40.8 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.4 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.2 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 162 aa  94.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  34.85 
 
 		 135 aa  93.6  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  39.23 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  40.8 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  36.72 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.28 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 167 aa  90.9  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  35.94 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  38.46 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.01 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 161 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  43.52 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  43.36 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  33.83 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  34.09 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>