More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0068 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  100 
 
 		 422 aa  859    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  100 
 
 		 422 aa  859    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  40.95 
 
 		 424 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  41.25 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  42.12 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  40.74 
 
 		 434 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  38.66 
 
 		 440 aa  309  5e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  38.66 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  41.79 
 
 		 446 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  39.24 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  40.5 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  39.66 
 
 		 435 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.39 
 
 		 428 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  41.25 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  39.21 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  39.51 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  37.77 
 
 		 426 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  38.69 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  38.16 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  37.53 
 
 		 428 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  38.16 
 
 		 442 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  40.14 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  39.65 
 
 		 437 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  37.64 
 
 		 442 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  38.79 
 
 		 421 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  39.11 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  36.72 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  39.11 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  37.05 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  37.41 
 
 		 442 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  39.39 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  39.9 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  35.84 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  36.64 
 
 		 442 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  36.05 
 
 		 442 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  38.01 
 
 		 443 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  38.61 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  38.84 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  36.26 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  34.97 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 441 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  39.48 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  35.68 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  35.68 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  38.85 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  35.68 
 
 		 442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  38.12 
 
 		 408 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  37.97 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  35.22 
 
 		 442 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  37.56 
 
 		 427 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  38.24 
 
 		 421 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  39.66 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  35.47 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  39.66 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  38.1 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  38.1 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  38.1 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  38.1 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  39.01 
 
 		 431 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  38.1 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  41.08 
 
 		 463 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  39.01 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  39.01 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  38.37 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  41.08 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  38.77 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  41.08 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  39.55 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  40.83 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  40.83 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  40.83 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  40.83 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  35.62 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  39.95 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  34.34 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  35.75 
 
 		 451 aa  259  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  37.7 
 
 		 474 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  37.47 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  34.08 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  34.79 
 
 		 440 aa  256  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  36.67 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  34.88 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  37.86 
 
 		 430 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  33.18 
 
 		 445 aa  255  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  37.62 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  35.44 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  36.19 
 
 		 430 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  33.49 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  36.47 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  33.25 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.67 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  36.67 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  36.67 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  36.67 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  36.67 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>