More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0046 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0045  sulfur/pyrite/thiosulfate/sulfide-induced protein  100 
 
 		 215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0046  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.49 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.49 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  41.77 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.66 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.33 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  29.23 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  39.47 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.62 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.77 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  40.26 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.82 
 
 		 484 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2857  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.871228  normal  0.0137642 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 		 127 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  30.13 
 
 		 820 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  33.33 
 
 		 711 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  33.75 
 
 		 113 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  39.47 
 
 		 135 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 167 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 153 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  40.54 
 
 		 137 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 123 aa  51.6  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  36.49 
 
 		 139 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  36.49 
 
 		 139 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 124 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 124 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  34.67 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  26.37 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 400 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 397 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.43 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  35.53 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  32.89 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 		 428 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 397 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  27.45 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  27.81 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2753  rhodanese-like protein  24.53 
 
 		 140 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 138 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  40.91 
 
 		 119 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 113 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  30.59 
 
 		 125 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 		 113 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.5 
 
 		 139 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  32.88 
 
 		 109 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.14 
 
 		 110 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  24 
 
 		 114 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 137 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.67 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 137 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 		 116 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>