198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0035 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 116 aa  229  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 116 aa  229  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  47.17 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  35 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  35 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  35 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  38.37 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  40.38 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  42.31 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  44.68 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  39.62 
 
 		 118 aa  67  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  37.04 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  37.74 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.08 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  31.13 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.07 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  34.34 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  32.04 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.07 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.07 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.07 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.07 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.07 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.13 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.07 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.63 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  37.63 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  37.63 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  38.46 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  33.96 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.78 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  36.47 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  40.74 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  43.01 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  26.47 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  39.29 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2146  ribonuclease P protein component  30.56 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164935  unclonable  0.0000011472 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  41.05 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  40.7 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  40.7 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  35.45 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  30.85 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  36.44 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  34.65 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  31.13 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  42.31 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  34.58 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  37.93 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  45.16 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  37.68 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  33.73 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  34.91 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  35.85 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  44.78 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  49.15 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  34 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  34.57 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  33.96 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  42.25 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  39.51 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  33.02 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  33.65 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  39.53 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  37.04 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  40.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  34.07 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  35.56 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  40 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  27.93 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  43.08 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  33.67 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  40.7 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  39.33 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  40.7 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>