63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0010 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0010  Septum formation topological specificity factor MinE  100 
 
 
42 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.409246  normal  0.0160788 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  97.22 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  97.22 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  56.41 
 
 
87 aa  50.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  53.85 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  54.29 
 
 
84 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  53.85 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  54.29 
 
 
84 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  0.0000000000271778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  51.28 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0007  cell division topological specificity factor MinE  51.28 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.256237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  59.38 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0277  cell division topological specificity factor MinE  57.58 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.510649  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  52.78 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  54.55 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1979  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3031  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.82909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2966  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.851828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2633  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2111  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0702094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1571  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0857  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.677449  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  45.71 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  50 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0845  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  46.34 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3239  cell division topological specificity factor MinE  56.25 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  53.12 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0062  cell division topological specificity factor MinE  53.12 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.301009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0657  cell division topological specificity factor MinE  53.12 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421809  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
85 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  43.24 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
84 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2034  cell division topological specificity factor MinE  47.5 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  52.94 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3687  cell division topological specificity factor MinE  54.55 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.54305  hitchhiker  0.000223876 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0296  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00745796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  47.06 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0323  cell division topological specificity factor MinE  48.72 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0226331  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  45.16 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000063438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  44.12 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>