176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4375 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4375  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
191 aa  391  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3716  hypothetical protein  57.29 
 
 
197 aa  222  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0110  MOSC domain-containing protein  58.42 
 
 
192 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.721008  normal  0.0279097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3580  MOSC domain-containing protein  50 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.482482  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3423  MOSC  47.85 
 
 
212 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7096  MOSC domain-containing protein  46.73 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1848  MOSC domain-containing protein  43.68 
 
 
203 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  43.79 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3230  MOSC domain containing protein  34.91 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  42.6 
 
 
226 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2475  MOSC domain containing protein  42.6 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4906  MOSC domain-containing protein  41.72 
 
 
227 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2442  MOSC domain-containing protein  40.22 
 
 
211 aa  121  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000472936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1921  MOSC domain-containing protein  40.12 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2166  MOSC domain containing protein  34.32 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00996581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  41.21 
 
 
549 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4809  MOSC domain containing protein  46.94 
 
 
227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.359001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00092  mosc domain protein  41.52 
 
 
237 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2577  MOSC domain containing protein  41.98 
 
 
220 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4660  MOSC domain containing protein  42.86 
 
 
220 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.287736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4273  hypothetical protein  38.76 
 
 
229 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.833084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2246  MOSC domain-containing protein  36.08 
 
 
229 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4454  hypothetical protein  39.08 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4386  hypothetical protein  39.08 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4342  hypothetical protein  39.08 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000280654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4302  hypothetical protein  38.2 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0963  MOSC domain-containing protein  31.18 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4419  MOSC domain containing protein  42.77 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5365  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326759  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3061  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068485  normal  0.778276 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  39.88 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5027  MOSC domain-containing protein  39.51 
 
 
233 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03796  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4074  MOSC domain containing protein  36.97 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03745  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4107  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4141  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2189  hypothetical protein  33.15 
 
 
228 aa  111  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4390  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  111  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2272  hypothetical protein  33.15 
 
 
228 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.762242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2232  hypothetical protein  33.15 
 
 
228 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00032832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2440  hypothetical protein  33.15 
 
 
228 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4303  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  111  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.445001  hitchhiker  0.00595644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2456  hypothetical protein  33.15 
 
 
228 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2534  hypothetical protein  33.15 
 
 
228 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4062  hypothetical protein  37.36 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00109067  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4291  MOSC domain-containing protein  41.28 
 
 
235 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0079  MOSC family protein  40 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138915  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2471  hypothetical protein  32.97 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5247  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5612  MOSC domain-containing protein  40 
 
 
234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882843  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4444  hypothetical protein  36.97 
 
 
224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  45.83 
 
 
241 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4123  MOSC domain-containing protein  38.27 
 
 
232 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1580  MOSC domain-containing protein  36.81 
 
 
235 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000909232  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2936  hypothetical protein  32.07 
 
 
229 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0245783  hitchhiker  0.00000764985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2397  hypothetical protein  32.04 
 
 
229 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0079  hypothetical protein  36.26 
 
 
223 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1762  MOSC domain-containing protein  37.87 
 
 
242 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0722092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1147  MOSC domain-containing protein  39.67 
 
 
208 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  43.15 
 
 
234 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1700  MOSC domain-containing protein  37.87 
 
 
242 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000356858  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1502  mosc domain-containing protein  33.54 
 
 
221 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4616  MOSC domain-containing protein  40.12 
 
 
234 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111886  hitchhiker  0.00165938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0313  MOSC domain containing protein  35.71 
 
 
212 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0191  MOSC domain-containing protein  41.14 
 
 
242 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0083  MOSC domain-containing protein  36.26 
 
 
230 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0145195  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  42.47 
 
 
234 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0651  hypothetical protein  39.39 
 
 
233 aa  104  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0181  MOSC  34.05 
 
 
213 aa  104  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1485  hypothetical protein  37.41 
 
 
232 aa  104  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0104541  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5441  MOSC domain-containing protein  40.37 
 
 
234 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165299  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0998  MOSC domain-containing protein  39.05 
 
 
229 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.759805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0030  MOSC domain containing protein  40.41 
 
 
230 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3024  mosc domain-containing protein  39.64 
 
 
239 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.076191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  34.43 
 
 
586 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2108  MOSC domain-containing protein  38.12 
 
 
228 aa  101  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4456  MOSC domain-containing protein  37.43 
 
 
250 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267556  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  36.31 
 
 
209 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1959  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 
229 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0802  MOSC domain-containing protein  37.87 
 
 
235 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4891  MOSC domain-containing protein  39.75 
 
 
234 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0553056 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0955  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 
229 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0870  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 
229 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0278  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 
229 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0356222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0280  MOSC domain-containing protein  36.81 
 
 
229 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.077384  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  37.2 
 
 
588 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0277  MOSC domain containing protein  36.81 
 
 
237 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0273  MOSC domain-containing protein  36.81 
 
 
231 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0210  MOSC domain containing protein  40.24 
 
 
242 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0281  MOSC domain-containing protein  36.81 
 
 
231 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  36.42 
 
 
241 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1159  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 
229 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4797  MOSC domain-containing protein  36.2 
 
 
232 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3752  MOSC domain-containing protein  36.9 
 
 
231 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1005  MOSC domain-containing protein  38.46 
 
 
229 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4456  hypothetical protein  36.81 
 
 
231 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06890  hypothetical protein  35.57 
 
 
233 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59857  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0270  MOSC domain-containing protein  36.9 
 
 
231 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112146  hitchhiker  0.00000109327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  38.16 
 
 
234 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>