More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4329 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  782    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  61.42 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  59.84 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  57.51 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  59.42 
 
 		 381 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  58.62 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  53.97 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  54.86 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  52.22 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  53.83 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  53.83 
 
 		 381 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  54.47 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  53.3 
 
 		 381 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  53.81 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  53.7 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  51.79 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  52.47 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  52.73 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  56.76 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  52.42 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  52.88 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  47.38 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  56.73 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  48.7 
 
 		 385 aa  352  7e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  48.95 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  48.72 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  47.27 
 
 		 385 aa  345  7e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  48.78 
 
 		 373 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  46.15 
 
 		 377 aa  342  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  47.38 
 
 		 391 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  46.58 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.48 
 
 		 380 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  46.98 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  47.79 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  46.41 
 
 		 395 aa  335  7e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  50 
 
 		 371 aa  332  5e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  46.32 
 
 		 382 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  46.24 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  45.69 
 
 		 399 aa  329  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  46.11 
 
 		 391 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  46.61 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  43.39 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  45.55 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  43.44 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  36.27 
 
 		 381 aa  289  4e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  40.41 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  39.43 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  40.26 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.7 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  40.21 
 
 		 390 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  40.63 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  39.84 
 
 		 390 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  39.84 
 
 		 390 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  39.84 
 
 		 390 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  39.23 
 
 		 388 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  39.33 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  43.01 
 
 		 378 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  40.84 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  40.1 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  37.73 
 
 		 392 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  39.58 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 		 390 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.8 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  42.74 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  35.84 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.83 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  34.85 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 384 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.92 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  33.25 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  34.14 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.62 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  31.17 
 
 		 384 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  32.51 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.43 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  29.01 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>