More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4264 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  82.52 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  77.2 
 
 		 338 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  80 
 
 		 322 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  79.73 
 
 		 309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  73.58 
 
 		 308 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  76.57 
 
 		 305 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  73.49 
 
 		 308 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  72.49 
 
 		 316 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  77.1 
 
 		 304 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  77.1 
 
 		 304 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  73.83 
 
 		 308 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  72.49 
 
 		 316 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  72.49 
 
 		 316 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  74.5 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  75.32 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  73.67 
 
 		 307 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  74.83 
 
 		 304 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  75.17 
 
 		 304 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  81.04 
 
 		 316 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  75.25 
 
 		 305 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  73.06 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  70.97 
 
 		 304 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  72.43 
 
 		 513 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  72.82 
 
 		 300 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  69.68 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  69.64 
 
 		 305 aa  444  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  70.97 
 
 		 310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  72.48 
 
 		 308 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  72.82 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  72.24 
 
 		 324 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  72.82 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  72.82 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  72.82 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  74.5 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  68.71 
 
 		 304 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  71.24 
 
 		 324 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  68.52 
 
 		 304 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  66.78 
 
 		 301 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  68.42 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  67.66 
 
 		 359 aa  424  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  70.81 
 
 		 316 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  75 
 
 		 305 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  64.88 
 
 		 305 aa  388  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  63.97 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  60.97 
 
 		 306 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  67.21 
 
 		 258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  63.42 
 
 		 256 aa  348  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  62.55 
 
 		 258 aa  348  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  64.68 
 
 		 288 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  62.26 
 
 		 320 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  60.4 
 
 		 276 aa  315  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  51.01 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  58.43 
 
 		 280 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  55.04 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  55.4 
 
 		 295 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  53.85 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  57.6 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  55.69 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  59.34 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  57.43 
 
 		 269 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  56.51 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  61.02 
 
 		 340 aa  295  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  62.95 
 
 		 314 aa  295  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  60.17 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  59.75 
 
 		 336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  59.5 
 
 		 340 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  56.38 
 
 		 280 aa  288  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  63.64 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  61.78 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  62.16 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  51.93 
 
 		 283 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  49.83 
 
 		 285 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  57.08 
 
 		 357 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  55.25 
 
 		 274 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  52.55 
 
 		 271 aa  285  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  56.33 
 
 		 298 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  59.05 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  59.05 
 
 		 301 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  52.31 
 
 		 270 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  60.36 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  61.36 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  59.28 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  53.79 
 
 		 375 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  60.36 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  60.81 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  55.28 
 
 		 369 aa  277  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  61.32 
 
 		 263 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  54.32 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  54.32 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  51.13 
 
 		 280 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  54.07 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  58.37 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  57.4 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  56.44 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  52.35 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  60.91 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  54.96 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  56.5 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  51.02 
 
 		 277 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>