157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4233 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  289  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  78.72 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  67.38 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  68.79 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  69.5 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  68.79 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  68.79 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  68.09 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  68.09 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  61.7 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  61.7 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  62.41 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  64.54 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  60.99 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  53.85 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  55.32 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  55.24 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  56.03 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  61.7 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  54.55 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  54.55 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  54.55 
 
 		 140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  54.55 
 
 		 140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  55.24 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  54.55 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  55.86 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  55.86 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  55.94 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  55.94 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  56.74 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  56.74 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  56.74 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  54.68 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  58.16 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  54.48 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  51.06 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0381  hypothetical protein  60.31 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.314635  normal  0.174306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  51.08 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  49.32 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  51.72 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  44.37 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  46.58 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  47.95 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  46.15 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  47.95 
 
 		 141 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  47.26 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  47.26 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  44.37 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  48.61 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  39.29 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  44.68 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  47.89 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  42.47 
 
 		 168 aa  103  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  44.37 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  47.62 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  43.26 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  38.78 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  47.95 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  46.15 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  47.18 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  41.96 
 
 		 178 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  46.58 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  37.16 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  41.43 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01813  hypothetical protein  39.04 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0118637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  41.67 
 
 		 177 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  42.96 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  39.58 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  39.86 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  37.41 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  38.03 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  38.46 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  36.73 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  43.36 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  38.3 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  38.31 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  39.19 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  35.37 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  36.73 
 
 		 184 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  36.99 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  38.31 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  34.51 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  34.72 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  41.41 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  36.99 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  32.65 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  42.14 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  36.99 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  33.56 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>