192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4228 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 221 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  53.81 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  51.1 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  50.75 
 
 		 220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  52.11 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  46.43 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  45.33 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  45.33 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  44.55 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  45.74 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  48.26 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  44.13 
 
 		 211 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  44.39 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  46.34 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  44.97 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  41.1 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.23 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.55 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.73 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.55 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  42.55 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.55 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.55 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.55 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  42.55 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.55 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  39.81 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  41.35 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  43.12 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  38.92 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  43.32 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  41.35 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  41.35 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  39.15 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  41.46 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  41.46 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  41.46 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  45.35 
 
 		 218 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.97 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  40.85 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.05 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.81 
 
 		 216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  41.1 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  37.89 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  41.38 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  38.34 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.83 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  35.63 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  37.07 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  35.23 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  37.85 
 
 		 271 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  35.26 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  30.32 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  37.11 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 260 aa  95.1  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  34.38 
 
 		 260 aa  94.7  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  30.29 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  30.29 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.24 
 
 		 207 aa  91.7  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.58 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.73 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.07 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.73 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.25 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  27.89 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  31.82 
 
 		 200 aa  88.6  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.11 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.93 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.67 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>