175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4200 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  736    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  67.21 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  59.69 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  64.44 
 
 		 359 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  62.71 
 
 		 366 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  58.24 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  59.5 
 
 		 359 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  59.78 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  58.68 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  57.85 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  60.45 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  60.45 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  60.72 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  60.45 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  60.45 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  60.45 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  60.11 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.06 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  60.17 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  59.67 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  60.61 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  58.95 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  58.95 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  58.95 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  59.89 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  58.4 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  58.84 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  54.82 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  59.34 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  59.33 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  50.87 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  48.75 
 
 		 342 aa  295  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  48.43 
 
 		 344 aa  289  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  42.49 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  38.62 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  40.11 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  38.57 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 400 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  40.06 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  40.17 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 		 349 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 		 354 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  40.06 
 
 		 363 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  36.93 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  39.09 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  37.11 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  37.79 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  36.83 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  38.3 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  40.71 
 
 		 335 aa  199  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  36.31 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  35.4 
 
 		 354 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.92 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  31.88 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  30.26 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  33.53 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  33.53 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  25.07 
 
 		 324 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  32.96 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  27.03 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1691  beta-lactamase domain protein  51.43 
 
 		 72 aa  77.8  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  31.47 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 		 862 aa  73.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.79 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.33 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  25.22 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.99 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  24.19 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  23.6 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  24.93 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>