45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4073 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  741    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  40.54 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  39.63 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  34.19 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  29.79 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  30.65 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  31.27 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  32.79 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  35.17 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  29.01 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  28.4 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  23.8 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  32.08 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  23.37 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  33.02 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  30.12 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  32.52 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  27.18 
 
 		 447 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  31.85 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  28.84 
 
 		 438 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.49 
 
 		 949 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  27.11 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  28.01 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  32.58 
 
 		 846 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  31.43 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 862 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 825 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 825 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 825 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 825 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 825 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 825 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  26.99 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  30.62 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  39.84 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  32.04 
 
 		 844 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  31.96 
 
 		 881 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 		 886 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  31.4 
 
 		 866 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  30.82 
 
 		 872 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 976 aa  56.2  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0930  hypothetical protein  29.84 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0087813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.77 
 
 		 870 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  25.38 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3786  hypothetical protein  29.56 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>