229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4071 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  100 
 
 
485 aa  964  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  57.79 
 
 
488 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  54.73 
 
 
498 aa  506  1e-142  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  51.03 
 
 
485 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  52.07 
 
 
485 aa  485  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  51.86 
 
 
485 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  55.12 
 
 
488 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  54.92 
 
 
488 aa  478  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  51.92 
 
 
488 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  49.28 
 
 
491 aa  461  1e-128  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  47.27 
 
 
483 aa  416  1e-115  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  47.48 
 
 
483 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  44.89 
 
 
482 aa  406  1e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  45.09 
 
 
483 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  41.88 
 
 
483 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  47.9 
 
 
484 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  43.87 
 
 
485 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  45.8 
 
 
482 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  44.05 
 
 
483 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  43.24 
 
 
485 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  44.17 
 
 
483 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  42.62 
 
 
485 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  42.62 
 
 
485 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  45.76 
 
 
483 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  42 
 
 
485 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  44.28 
 
 
485 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  45.09 
 
 
483 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  44.24 
 
 
485 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  44.12 
 
 
482 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  44.07 
 
 
485 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.91681e-06  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  44.07 
 
 
485 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  41.79 
 
 
485 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  43.01 
 
 
486 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  46.01 
 
 
483 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  43.37 
 
 
485 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  45.8 
 
 
483 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.85721e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  45.8 
 
 
483 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.58715e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  46.01 
 
 
483 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  45.8 
 
 
483 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.1848e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  46.01 
 
 
483 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.96268e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  45.8 
 
 
483 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.58223e-06  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  43.79 
 
 
485 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  45.8 
 
 
483 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  45.8 
 
 
483 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.19761e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  46.01 
 
 
483 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  46.01 
 
 
483 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  46.01 
 
 
483 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  43.79 
 
 
485 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99675e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  45.8 
 
 
483 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  43.79 
 
 
485 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  45.8 
 
 
483 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.16067e-05  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  43.79 
 
 
485 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  45.8 
 
 
483 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  3.37879e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  45.13 
 
 
483 aa  363  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  43.92 
 
 
481 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  42 
 
 
485 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  46.79 
 
 
483 aa  362  6e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  44.93 
 
 
483 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  42.89 
 
 
481 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  45.59 
 
 
483 aa  358  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  41.89 
 
 
488 aa  357  3e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  46.43 
 
 
483 aa  357  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.8042e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  43.42 
 
 
485 aa  356  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  46.22 
 
 
483 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.59691e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  46.22 
 
 
483 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.78342e-06  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  43 
 
 
485 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  45.3 
 
 
482 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  43.42 
 
 
485 aa  346  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.21 
 
 
479 aa  336  6e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  41.85 
 
 
483 aa  333  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  37.6 
 
 
486 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.93317e-06  unclonable  5.82873e-08 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  42.65 
 
 
481 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  38.08 
 
 
479 aa  328  1e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  37.42 
 
 
487 aa  328  2e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  38.6 
 
 
486 aa  327  4e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  40.66 
 
 
474 aa  325  8e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  40.43 
 
 
485 aa  325  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.77 
 
 
478 aa  324  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  43.19 
 
 
491 aa  323  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  44.85 
 
 
494 aa  322  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  41.7 
 
 
482 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  41.8 
 
 
466 aa  319  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  41.69 
 
 
480 aa  314  2e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  36.82 
 
 
483 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  37.28 
 
 
484 aa  310  3e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.4 
 
 
498 aa  310  3e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.26 
 
 
476 aa  310  3e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  38.54 
 
 
483 aa  308  2e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  41.39 
 
 
483 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  37.32 
 
 
481 aa  305  1e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  36.08 
 
 
481 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  36.7 
 
 
481 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  38.17 
 
 
482 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  38.22 
 
 
481 aa  293  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  38.43 
 
 
481 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  38.32 
 
 
482 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  39.5 
 
 
484 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  35.28 
 
 
485 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  36.63 
 
 
480 aa  293  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  38.43 
 
 
481 aa  293  6e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>