More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4066 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
543 aa  1083    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  52.47 
 
 
620 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.11 
 
 
627 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
628 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  45.99 
 
 
661 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  41.67 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.13 
 
 
681 aa  213  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 
691 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.89 
 
 
668 aa  210  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  43.45 
 
 
750 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  41.14 
 
 
573 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 
612 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.25 
 
 
693 aa  207  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.36 
 
 
601 aa  206  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  45.31 
 
 
425 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.26 
 
 
647 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.59 
 
 
627 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.33 
 
 
747 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  44.44 
 
 
623 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 
700 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  41.85 
 
 
866 aa  203  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  40.23 
 
 
869 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  41.8 
 
 
825 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 
690 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.41 
 
 
850 aa  200  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 
615 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.26 
 
 
613 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  38.52 
 
 
667 aa  197  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  43.89 
 
 
758 aa  198  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  40.28 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  42.65 
 
 
597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.67 
 
 
579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  43.07 
 
 
618 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  41.29 
 
 
907 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  39.26 
 
 
703 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  39.86 
 
 
736 aa  196  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.51 
 
 
641 aa  196  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.27 
 
 
650 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.64 
 
 
1023 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.1 
 
 
769 aa  194  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  42.01 
 
 
598 aa  193  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
891 aa  193  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.36 
 
 
822 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.97 
 
 
603 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.49 
 
 
594 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
666 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  40.69 
 
 
618 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.04 
 
 
700 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  39.65 
 
 
938 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 
1122 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  40.98 
 
 
623 aa  190  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  42.64 
 
 
658 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.74 
 
 
681 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  39.02 
 
 
599 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  39.55 
 
 
781 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
776 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  39.67 
 
 
668 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 
571 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  41.24 
 
 
609 aa  187  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  42.54 
 
 
562 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  39.18 
 
 
454 aa  186  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  38.64 
 
 
625 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 
582 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0106  Serine/threonine protein kinase-like  40.08 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.85 
 
 
653 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  44 
 
 
557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  36.33 
 
 
621 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.3 
 
 
668 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 
642 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 
673 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.93 
 
 
667 aa  183  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.15 
 
 
584 aa  183  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
651 aa  182  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 
641 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 
691 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.72 
 
 
798 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.46 
 
 
728 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.63 
 
 
648 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.3 
 
 
645 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
647 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  36.5 
 
 
638 aa  181  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.66 
 
 
662 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 
625 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
569 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  38.43 
 
 
604 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.06 
 
 
863 aa  180  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.55 
 
 
658 aa  180  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  42.34 
 
 
620 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  38.89 
 
 
672 aa  179  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.69 
 
 
652 aa  180  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
624 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
624 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
624 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4393  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.02 
 
 
1019 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.618951  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
601 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.41 
 
 
664 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  42.86 
 
 
820 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.3 
 
 
520 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
651 aa  179  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>