30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4058 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  37.84 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  37.84 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  31.56 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  37.55 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  46.3 
 
 		 478 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  43.09 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  25.22 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  35.88 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  24.23 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  42.53 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  30.28 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  31.43 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  37.63 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  33.09 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  29.58 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  38.37 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  37.63 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  29.93 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  29.2 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  29.2 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  32.56 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  29.2 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  29.2 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  28.47 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  28.47 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  28.47 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  33.72 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  26.98 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>