154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4055 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  100 
 
 		 445 aa  881    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  47.77 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  46.07 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  48.43 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  46.58 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  46.36 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  46.58 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  46.58 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  46.58 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  46.58 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  46.58 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  46.26 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  44.39 
 
 		 446 aa  358  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  45.85 
 
 		 472 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  44.94 
 
 		 444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  44.62 
 
 		 458 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  44.49 
 
 		 444 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  43.82 
 
 		 445 aa  349  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  41.03 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  42.47 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  41.8 
 
 		 443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  36.77 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  42.47 
 
 		 444 aa  328  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  42.32 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  36.63 
 
 		 441 aa  318  9e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  36.18 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  37.72 
 
 		 448 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  37.72 
 
 		 448 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  41.83 
 
 		 443 aa  312  9e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  39.46 
 
 		 445 aa  309  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  34.53 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38.79 
 
 		 445 aa  306  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  39.6 
 
 		 448 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  40.53 
 
 		 447 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  36.55 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  42.08 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  37.64 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  38.08 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  38.08 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  41.81 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  34.08 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38.75 
 
 		 447 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  37.89 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38.12 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  39.42 
 
 		 448 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  39.42 
 
 		 448 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  39.42 
 
 		 448 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  39.42 
 
 		 448 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  39.42 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  39.42 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  39.2 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  36.83 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  36.61 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  36.61 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  36.61 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  36.75 
 
 		 480 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  36.75 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  36.75 
 
 		 452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  37.86 
 
 		 445 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  36.59 
 
 		 448 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  36.17 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  36.17 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  36.3 
 
 		 480 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  37.28 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  37.64 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  35.73 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  35.73 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  35.73 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  35.86 
 
 		 449 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  37.25 
 
 		 447 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  35.79 
 
 		 443 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  38.53 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  36.5 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  36.5 
 
 		 443 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  38.31 
 
 		 445 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  35.29 
 
 		 443 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  36.67 
 
 		 445 aa  262  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  37.9 
 
 		 416 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  37.64 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  34.17 
 
 		 440 aa  249  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.41 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  34.02 
 
 		 432 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  29.93 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  29.61 
 
 		 451 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  29.61 
 
 		 451 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  35.35 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  35.12 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  35.12 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  35.12 
 
 		 453 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  27.62 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  29.18 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  29 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  28.29 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  28.73 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  33.81 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  28.95 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  28.73 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0023  hypothetical protein  47.74 
 
 		 159 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  27.37 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1178  type VI secretion protein  22.25 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>