More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4046 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  333  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  65.66 
 
 		 166 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  63.76 
 
 		 203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  64.79 
 
 		 168 aa  209  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  62.04 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  62.04 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  59.85 
 
 		 165 aa  201  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  56.95 
 
 		 171 aa  197  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  58.99 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  56.25 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 		 174 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  47.56 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  55.32 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  55.32 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  55.32 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  55.32 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  55.32 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  55.32 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  55.32 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  54.61 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  54.35 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  53.62 
 
 		 178 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  53.57 
 
 		 176 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  52.9 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  48.15 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  46.54 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  52.9 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  52.9 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  52.9 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  52.9 
 
 		 194 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  50 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  55.07 
 
 		 164 aa  166  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  51.43 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  47.56 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  51.75 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.79 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  46.62 
 
 		 167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  36.75 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  38.75 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.86 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  35.34 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  42.73 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  42.34 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.69 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.11 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.5 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  35.21 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  34.4 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.51 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.62 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  29.61 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  31.58 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 		 173 aa  84  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  84  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  32.05 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  33.76 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  31.25 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.1 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.19 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.36 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  38.26 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.83 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  31.58 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.24 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  34.59 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  29.29 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  29.29 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  29.29 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  31.58 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  29.29 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  29.29 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  29.94 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  31.85 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  34.62 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  32.41 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  34.62 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  37.5 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  32.09 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  33.85 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.85 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  35.9 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.93 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  28.57 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  33.59 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  31.62 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  31.78 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  35.56 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.53 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  33.08 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.94 
 
 		 609 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>