More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3984 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  63.7 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.93 
 
 		 182 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  54.61 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  56.49 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  49.68 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  51.41 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  52.63 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  49.29 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  45.26 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  40.94 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  40.58 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  42.25 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  42.97 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  42.65 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  41.91 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  42.97 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  42.97 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  42.97 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  42.97 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  42.97 
 
 		 186 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  42.97 
 
 		 186 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  42.97 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.09 
 
 		 175 aa  124  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  39.57 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  38.13 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  38.85 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  38.85 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  38.85 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  38.78 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  40.62 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  42.11 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  36.9 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  42.98 
 
 		 171 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.21 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  33.33 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  46.36 
 
 		 135 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  34.41 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  43.3 
 
 		 167 aa  94.4  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.65 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  25.77 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  37.5 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  36 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  35.14 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  34.13 
 
 		 183 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  25.26 
 
 		 173 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  25.26 
 
 		 173 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  26.29 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  25.26 
 
 		 173 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  24.23 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  24.23 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.77 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  23.71 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.14 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  23.2 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  38.98 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.94 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  30.65 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  23.59 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  33.7 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  37.84 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  36.7 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  32.54 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.98 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  35.29 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  36.64 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.35 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  31.93 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  33.09 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  40 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.59 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  35.29 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  27.67 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.88 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  38.33 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.36 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  38.67 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  40.65 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  38.58 
 
 		 278 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  28.36 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  35.59 
 
 		 164 aa  72  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  30.58 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  32.34 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  28.89 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  40.65 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  31.39 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.58 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.77 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  32.88 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  30.69 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  32.85 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  34.07 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  33.1 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.6 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>