53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3940 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4583  glutamate--cysteine ligase GshA  80.97 
 
 		 431 aa  752    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0426  glutamate/cysteine ligase  70.18 
 
 		 436 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553194  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3259  glutamate/cysteine ligase  78.19 
 
 		 431 aa  720    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0191292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0763  glutamate--cysteine ligase GshA  73.55 
 
 		 431 aa  678    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3940  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 		 431 aa  888    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5997  glutamate--cysteine ligase  74.48 
 
 		 431 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724112  hitchhiker  0.00190947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4542  glutamate--cysteine ligase  77.73 
 
 		 431 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.907644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0173  putative glutamate--cysteine ligase  85.85 
 
 		 431 aa  782    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1252  glutamate--cysteine ligase  71 
 
 		 429 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3910  glutamate--cysteine ligase  78.19 
 
 		 431 aa  720    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.80234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3750  glutamate--cysteine ligase  76.8 
 
 		 431 aa  711    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0293  glutamate--cysteine ligase GshA  69.7 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4188  putative glutamate-cysteine ligase  67.6 
 
 		 429 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1955  glutamate--cysteine ligase  68.06 
 
 		 432 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0527  glutamate/cysteine ligase  67.37 
 
 		 429 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0200  glutamate/cysteine ligase  69 
 
 		 431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770755  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0219  glutamate/cysteine ligase  69 
 
 		 431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0242  glutamate--cysteine ligase GshA  69.93 
 
 		 431 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0344  hypothetical protein  68.3 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1660  glutamate--cysteine ligase  67.82 
 
 		 432 aa  594  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.851286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0258  glutamate--cysteine ligase  65.03 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0409  glutamate--cysteine ligase  66.2 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0470  glutamate--cysteine ligase  66.2 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0489  glutamate--cysteine ligase  66.2 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0654  glutamate--cysteine ligase  66.2 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2781  glutamate--cysteine ligase  65.11 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2919  glutamate--cysteine ligase  65.11 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3215  hypothetical protein  65.97 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0189  glutamate--cysteine ligase  65.97 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6193  glutamate--cysteine ligase GshA  65.34 
 
 		 429 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1403  glutamate--cysteine ligase  65.97 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2830  glutamate--cysteine ligase  65.97 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0011  glutamate--cysteine ligase GshA  63.76 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0602184 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2875  glutamate--cysteine ligase  65.11 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  0.177007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0439  glutamate--cysteine ligase  65.11 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2864  glutamate--cysteine ligase  65.11 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00201852  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2250  glutamate--cysteine ligase GshA  65.11 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2408  glutamate--cysteine ligase GshA  62.23 
 
 		 426 aa  554  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0573  glutamate/cysteine ligase  61.21 
 
 		 437 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2516  glutamate--cysteine ligase GshA  60.8 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0216  glutamate--cysteine ligase GshA  60.33 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1824  glutamate--cysteine ligase GshA  51.84 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1811  hypothetical protein  52.33 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1812  hypothetical protein  52.09 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0513  glutamate/cysteine ligase  48.94 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2671  glutamate/cysteine ligase  50.71 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.630756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2076  glutamate--cysteine ligase  49.64 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000044914  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3064  glutamate--cysteine ligase  50.71 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0105  glutamate--cysteine ligase  49.64 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.005063  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0125  glutamate--cysteine ligase  35.15 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0076  glutamate-cysteine ligase-related protein  36.09 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1188  glutamate--cysteine ligase-related protein  32.92 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0308  glutamate--cysteine ligase  35.71 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>